Quantitative imaging of collective cell migration during Drosophila gastrulation: multiphoton microscopy and computational analysis.
Quantitative imaging of collective cell migration during Drosophila gastrulation: multiphoton microscopy and computational analysis.
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DOI：
10.1038/nprot.2009.130
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发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
14.8
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
该协议描述了成像和计算工具，以收集和分析胚胎细胞迁移的实时成像数据。我们的五步方案需要几周的时间来完成胚胎准备和使用多光子显微镜进行的四维（4D）实时成像，以及使用图像处理进行的3D细胞跟踪，跟踪数据的配准以及使用计算工具进行的定量分析。它使用商业上可用的设备，并需要在显微镜和编程，是适合生物实验室的专业知识。提供了定制的脚本，以及样本数据集，以允许没有实验数据的读者进行分析。该协议提供了新的见解果蝇原肠胚细胞迁移的遗传控制。通过简单的改变，这种系统分析可以应用于任何开发系统，以根据身体计划定义细胞位置，分解复杂的3D运动，并量化细胞迁移的集体性质。
This protocol describes imaging and computational tools to collect and analyze live imaging data of embryonic cell migration. Our five step protocol requires a few weeks to move through embryo preparation and four-dimensional (4D) live imaging using multiphoton microscopy, to 3D cell-tracking using image processing, registration of tracking data, and their quantitative analysis using computational tools. It uses commercially available equipment, and requires expertise in microscopy and programming that is appropriate for a biology laboratory. Custom-made scripts are provided, as well as sample datasets to permit readers without experimental data to perform the analysis. The protocol has offered new insights into the genetic control of cell migration during Drosophila gastrulation. With simple changes, this systematic analysis could be applied to any developing system to define cell positions in accordance with the body plan, to decompose complex 3D movements, and to quantify the collective nature of cell migration.
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DOI：
10.1073/pnas.0606100103
发表时间：
2006-12-26
影响因子：
11.1
作者：
Zamir, Evan A.;Czirok, Andras;Rongish, Brenda J.
通讯作者：
Rongish, Brenda J.
果蝇胃肠道的动态分析提供了对集体细胞迁移的见解。
DOI：
10.1126/science.1167094
发表时间：
2008-12-05
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
McMahon A;Supatto W;Fraser SE;Stathopoulos A
通讯作者：
Stathopoulos A
影响因子：
64.5
作者：
Welte, MA;Gross, SP;Wieschaus, EF
通讯作者：
Wieschaus, EF
影响因子：
48
作者：
Ji, Na;Magee, Jeffrey C.;Betzig, Eric
通讯作者：
Betzig, Eric
影响因子：
3
作者：
Oheim, M;Beaurepaire, E;Charpak, S
通讯作者：
Charpak, S