Single-Cell Sequencing of Brain Cell Transcriptomes and Epigenomes.
Single-Cell Sequencing of Brain Cell Transcriptomes and Epigenomes.
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DOI：
10.1016/j.neuron.2020.12.010
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发表时间：
2021-01-06
期刊：
影响因子：
16.2
通讯作者：
Mukamel EA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Armand EJ;Li J;Xie F;Luo C;Mukamel EA
单细胞测序技术，包括转录组学和表观基因组学测定，正在改变我们对神经回路细胞构建块的理解。通过直接测量数千至数百万个单个细胞中的多个分子特征，单细胞测序方法可以全面表征脑细胞类型的多样性。这些测量揭示了塑造细胞身份的基因调控机制，并为脑细胞群之间的发育和进化关系提供了见解。单细胞测序数据可以帮助设计用于脑回路组件的靶向功能研究的工具，将分子特征与解剖学、连接性、形态学和生理学联系起来。在这里，我们讨论了单细胞转录组和表观基因组测序的基本原理，数据的综合计算分析，以及在神经科学中的关键应用。对单细胞的转录组和表观基因组进行测序能够以高通量对脑细胞进行深入的分子表征。Armand，Li，Xie等人回顾了关键的实验原理和计算方法，并讨论了最近在神经科学中具有里程碑意义的应用。
Single cell sequencing technologies, including transcriptomic and epigenomic assays, are transforming our understanding of the cellular building blocks of neural circuits. By directly measuring multiple molecular signatures in thousands to millions of individual cells, single cell sequencing methods can comprehensively characterize the diversity of brain cell types. These measurements uncover gene regulatory mechanisms that shape cellular identity and provide insight into developmental and evolutionary relationships between brain cell populations. Single cell sequencing data can aid the design of tools for targeted functional studies of brain circuit components, linking molecular signatures with anatomy, connectivity, morphology and physiology. Here, we discuss the fundamental principles of single cell transcriptome and epigenome sequencing, integrative computational analysis of the data, and key applications in neuroscience. Sequencing the transcriptomes and epigenomes of single cells enables deep molecular characterization of brain cells with high throughput. Armand, Li, Xie et al. review the key experimental principles and computational methods and discuss recent landmark applications in neuroscience.
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影响因子：
64.8
作者：
Cao, Junyue;Spielmann, Malte;Shendure, Jay
通讯作者：
Shendure, Jay
光学成像。膨胀显微镜。
DOI：
10.1126/science.1260088
发表时间：
2015-01-30
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Chen F;Tillberg PW;Boyden ES
通讯作者：
Boyden ES
影响因子：
64.5
作者：
Davie K;Janssens J;Koldere D;De Waegeneer M;Pech U;Kreft Ł;Aibar S;Makhzami S;Christiaens V;Bravo González-Blas C;Poovathingal S;Hulselmans G;Spanier KI;Moerman T;Vanspauwen B;Geurs S;Voet T;Lammertyn J;Thienpont B;Liu S;Konstantinides N;Fiers M;Verstreken P;Aerts S
通讯作者：
Aerts S
DOI：
10.1073/pnas.1507125112
发表时间：
2015-06-09
影响因子：
11.1
作者：
Darmanis S;Sloan SA;Zhang Y;Enge M;Caneda C;Shuer LM;Hayden Gephart MG;Barres BA;Quake SR
通讯作者：
Quake SR
影响因子：
2.5
作者：
Azevedo, Frederico A. C.;Carvalho, Ludmila R. B.;Herculano-Houzel, Suzana
通讯作者：
Herculano-Houzel, Suzana