Ten quick tips for machine learning in computational biology.
Ten quick tips for machine learning in computational biology.
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DOI：
10.1186/s13040-017-0155-3
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发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
4.5
通讯作者：
Chicco D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chicco D
机器学习已经成为计算生物学、生物信息学和健康信息学中许多项目的关键工具。然而，初学者和生物医学研究人员往往没有足够的经验来有效地运行数据挖掘项目，因此可能会遵循不正确的做法，这可能会导致常见的错误或过于乐观的结果。通过这篇综述，我们提出了在任何计算生物学背景下利用机器学习的十个快速提示，避免了我们在多个生物信息学项目中观察到数百次的一些常见错误。我们相信我们的十条建议可以有力地帮助任何机器学习从业者在计算生物学和相关科学领域进行成功的项目。
Machine learning has become a pivotal tool for many projects in computational biology, bioinformatics, and health informatics. Nevertheless, beginners and biomedical researchers often do not have enough experience to run a data mining project effectively, and therefore can follow incorrect practices, that may lead to common mistakes or over-optimistic results. With this review, we present ten quick tips to take advantage of machine learning in any computational biology context, by avoiding some common errors that we observed hundreds of times in multiple bioinformatics projects. We believe our ten suggestions can strongly help any machine learning practitioner to carry on a successful project in computational biology and related sciences.
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DOI：
10.1109/tcbb.2014.2382127
发表时间：
2015-07-01
影响因子：
4.5
作者：
Chicco, Davide;Masseroli, Marco
通讯作者：
Masseroli, Marco
影响因子：
5.9
作者：
Halligan, Steve;Altman, Douglas G.;Mallett, Susan
通讯作者：
Mallett, Susan
影响因子：
14.9
作者：
Gene Ontology Consortium;Blake JA;Dolan M;Drabkin H;Hill DP;Li N;Sitnikov D;Bridges S;Burgess S;Buza T;McCarthy F;Peddinti D;Pillai L;Carbon S;Dietze H;Ireland A;Lewis SE;Mungall CJ;Gaudet P;Chrisholm RL;Fey P;Kibbe WA;Basu S;Siegele DA;McIntosh BK;Renfro DP;Zweifel AE;Hu JC;Brown NH;Tweedie S;Alam-Faruque Y;Apweiler R;Auchinchloss A;Axelsen K;Bely B;Blatter M-;Bonilla C;Bouguerleret L;Boutet E;Breuza L;Bridge A;Chan WM;Chavali G;Coudert E;Dimmer E;Estreicher A;Famiglietti L;Feuermann M;Gos A;Gruaz-Gumowski N;Hieta R;Hinz C;Hulo C;Huntley R;James J;Jungo F;Keller G;Laiho K;Legge D;Lemercier P;Lieberherr D;Magrane M;Martin MJ;Masson P;Mutowo-Muellenet P;O'Donovan C;Pedruzzi I;Pichler K;Poggioli D;Porras Millán P;Poux S;Rivoire C;Roechert B;Sawford T;Schneider M;Stutz A;Sundaram S;Tognolli M;Xenarios I;Foulgar R;Lomax J;Roncaglia P;Khodiyar VK;Lovering RC;Talmud PJ;Chibucos M;Giglio MG;Chang H-;Hunter S;McAnulla C;Mitchell A;Sangrador A;Stephan R;Harris MA;Oliver SG;Rutherford K;Wood V;Bahler J;Lock A;Kersey PJ;McDowall DM;Staines DM;Dwinell M;Shimoyama M;Laulederkind S;Hayman T;Wang S-;Petri V;Lowry T;D'Eustachio P;Matthews L;Balakrishnan R;Binkley G;Cherry JM;Costanzo MC;Dwight SS;Engel SR;Fisk DG;Hitz BC;Hong EL;Karra K;Miyasato SR;Nash RS;Park J;Skrzypek MS;Weng S;Wong ED;Berardini TZ;Huala E;Mi H;Thomas PD;Chan J;Kishore R;Sternberg P;Van Auken K;Howe D;Westerfield M
通讯作者：
Westerfield M
影响因子：
5.7
作者：
Hand, David J.
通讯作者：
Hand, David J.
DOI：
10.1109/tcbb.2015.2459694
发表时间：
2016-03-01
影响因子：
4.5
作者：
Chicco, Davide;Masseroli, Marco
通讯作者：
Masseroli, Marco