Emergence and Spread of SARS-CoV-2 Lineages B.1.1.7 and P.1 in Italy.
Emergence and Spread of SARS-CoV-2 Lineages B.1.1.7 and P.1 in Italy.
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DOI：
10.3390/v13050794
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发表时间：
2021-04-29
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Lorusso A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Di Giallonardo F;Puglia I;Curini V;Cammà C;Mangone I;Calistri P;Cobbin JCA;Holmes EC;Lorusso A
意大利的第二波SARS-CoV-2袭击严重，有300多万例病例和10多万例死亡，比2020年8月报告的数字增加了近10倍。在此，我们对2020年1月29日至2021年3月1日期间在意大利采样的6515个SARS-CoV-2序列进行了分析，并显示了不同的谱系如何在封锁限制下多次独立出现。病毒谱系B.1.177在2020年11月成为主要变种，当时病例达到每天4万例的峰值，但自2021年1月以来，它被B.1.1.7“令人担忧的变种”所取代。此外，我们报告从2020年12月起，另一种记录在案的关注变种-谱系p1 -突然增加，很可能是由一次传入意大利引起的。我们再次强调国际输入如何推动新谱系的出现，基因组测序仍应是意大利持续监测的首要任务。
Italy’s second wave of SARS-CoV-2 has hit hard, with more than three million cases and over 100,000 deaths, representing an almost ten-fold increase in the numbers reported by August 2020. Herein, we present an analysis of 6515 SARS-CoV-2 sequences sampled in Italy between 29 January 2020 and 1 March 2021 and show how different lineages emerged multiple times independently despite lockdown restrictions. Virus lineage B.1.177 became the dominant variant in November 2020, when cases peaked at 40,000 a day, but since January 2021 this is being replaced by the B.1.1.7 ‘variant of concern’. In addition, we report a sudden increase in another documented variant of concern—lineage P.1—from December 2020 onwards, most likely caused by a single introduction into Italy. We again highlight how international importations drive the emergence of new lineages and that genome sequencing should remain a top priority for ongoing surveillance in Italy.
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SARS-COV-2血统的估计可传播和影响B.1.1.7在英国。
DOI：
10.1126/science.abg3055
发表时间：
2021-04-09
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Davies NG;Abbott S;Barnard RC;Jarvis CI;Kucharski AJ;Munday JD;Pearson CAB;Russell TW;Tully DC;Washburne AD;Wenseleers T;Gimma A;Waites W;Wong KLM;van Zandvoort K;Silverman JD;CMMID COVID-19 Working Group;COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium;Diaz-Ordaz K;Keogh R;Eggo RM;Funk S;Jit M;Atkins KE;Edmunds WJ
通讯作者：
Edmunds WJ
影响因子：
11.8
作者：
Maggi F;Novazzi F;Genoni A;Baj A;Spezia PG;Focosi D;Zago C;Colombo A;Cassani G;Pasciuta R;Tamborini A;Rossi A;Prestia M;Capuano R;Azzi L;Donadini A;Catanoso G;Grossi PA;Maffioli L;Bonelli G
通讯作者：
Bonelli G
DOI：
10.1016/s0140-6736(21)00183-5
发表时间：
2021-02-06
期刊：
Lancet (London, England)
影响因子：
--
作者：
Sabino EC;Buss LF;Carvalho MPS;Prete CA Jr;Crispim MAE;Fraiji NA;Pereira RHM;Parag KV;da Silva Peixoto P;Kraemer MUG;Oikawa MK;Salomon T;Cucunuba ZM;Castro MC;de Souza Santos AA;Nascimento VH;Pereira HS;Ferguson NM;Pybus OG;Kucharski A;Busch MP;Dye C;Faria NR
通讯作者：
Faria NR
影响因子：
14.9
作者：
Trifinopoulos J;Nguyen LT;von Haeseler A;Minh BQ
通讯作者：
Minh BQ
影响因子：
10.7
作者：
Nguyen LT;Schmidt HA;von Haeseler A;Minh BQ
通讯作者：
Minh BQ