The Hitchhiker's guide to Hi-C analysis: practical guidelines.
The Hitchhiker's guide to Hi-C analysis: practical guidelines.
复制标题
DOI：
10.1016/j.ymeth.2014.10.031
复制
发表时间：
2015-01-15
期刊：
影响因子：
4.8
通讯作者：
Kaplan, Noam
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lajoie, Bryan R.;Dekker, Job;Kaplan, Noam
在过去的十年中，开发和应用的一套分子基因组方法的基础上的染色体构象捕获方法（3C），结合越来越强大的成像方法，使高分辨率和全基因组分析的染色体的空间组织。本文的目的是为分析和解释全基因组3C方法（如Hi-C和3C-seq）获得的数据提供指导，这些方法依赖于深度测序来检测和量化全基因组的成对染色质相互作用。
Over the last decade, development and application of a set of molecular genomic approaches based on the chromosome conformation capture method (3C), combined with increasingly powerful imaging approaches, have enabled high resolution and genome-wide analysis of the spatial organization of chromosomes. The aim of this paper is to provide guidelines for analyzing and interpreting data obtained with genome-wide 3C methods such as Hi-C and 3C-seq that rely on deep sequencing to detect and quantify pairwise chromatin interactions genome-wide.
登录
查看更多内容
影响因子：
64.8
作者：
Jin, Fulai;Li, Yan;Dixon, Jesse R.;Selvaraj, Siddarth;Ye, Zhen;Lee, Ah Young;Yen, Chia-An;Schmitt, Anthony D.;Espinoza, Celso A.;Ren, Bing
通讯作者：
Ren, Bing
染色体接触图的标准化。
影响因子：
4.4
作者：
Cournac A;Marie-Nelly H;Marbouty M;Koszul R;Mozziconacci J
通讯作者：
Mozziconacci J
增强子和启动子相互作用长距离。
影响因子：
4
作者：
Krivega, Ivan;Dean, Ann
通讯作者：
Dean, Ann
α-珠蛋白基因结构域的三维折叠揭示了染色质球的形成。
影响因子：
16.8
作者：
通讯作者：
--
预测聚合物建模揭示了染色体构象和转录中的波动耦合。
影响因子：
64.5
作者：
Giorgetti L;Galupa R;Nora EP;Piolot T;Lam F;Dekker J;Tiana G;Heard E
通讯作者：
Heard E