GenVisR: Genomic Visualizations in R.
GenVisR: Genomic Visualizations in R.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btw325
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发表时间：
2016-10-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Griffith M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Skidmore ZL;Wagner AH;Lesurf R;Campbell KM;Kunisaki J;Griffith OL;Griffith M
摘要：可视化和总结来自基因组研究的数据仍然是一个挑战。在这里，我们介绍GenVisR包，通过提供高度可定制的、出版物质量的图形，专注于队列水平的基因组分析来应对这一挑战。GenVisR提供了一套快速且易于使用的基因组可视化工具，同时通过利用ggplot2和BioConductor的能力保持了高度的灵活性。可用性和实现：GenVisR是一个R包，可通过BioConductor(https://bioconductor.org/packages/GenVisR)，GPLv3.可通过GitHub(https://github.com/griffithlab/GenVisR/issues)和BioConductor支持网站获得支持。联系方式：obigriffith@wustl.edu或mgriffit@wustl.edu补充信息：补充数据可在BioInformation Online上获得。
Summary: Visualizing and summarizing data from genomic studies continues to be a challenge. Here, we introduce the GenVisR package to addresses this challenge by providing highly customizable, publication-quality graphics focused on cohort level genome analyses. GenVisR provides a rapid and easy-to-use suite of genomic visualization tools, while maintaining a high degree of flexibility by leveraging the abilities of ggplot2 and Bioconductor. Availability and Implementation: GenVisR is an R package available via Bioconductor (https://bioconductor.org/packages/GenVisR) under GPLv3. Support is available via GitHub (https://github.com/griffithlab/GenVisR/issues) and the Bioconductor support website. Contacts: obigriffith@wustl.edu or mgriffit@wustl.edu Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online.
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影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--
DOI：
10.1158/1078-0432.ccr-15-1745
发表时间：
2016-04-01
期刊：
Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
影响因子：
--
作者：
Ma CX;Luo J;Naughton M;Ademuyiwa F;Suresh R;Griffith M;Griffith OL;Skidmore ZL;Spies NC;Ramu A;Trani L;Pluard T;Nagaraj G;Thomas S;Guo Z;Hoog J;Han J;Mardis E;Lockhart C;Ellis MJ
通讯作者：
Ellis MJ
影响因子：
14.9
作者：
Kodama Y;Shumway M;Leinonen R;International Nucleotide Sequence Database Collaboration
通讯作者：
International Nucleotide Sequence Database Collaboration
影响因子：
12.3
作者：
Pengelly RJ;Gibson J;Andreoletti G;Collins A;Mattocks CJ;Ennis S
通讯作者：
Ennis S
影响因子：
4.3
作者：
Griffith M;Griffith OL;Smith SM;Ramu A;Callaway MB;Brummett AM;Kiwala MJ;Coffman AC;Regier AA;Oberkfell BJ;Sanderson GE;Mooney TP;Nutter NG;Belter EA;Du F;Long RL;Abbott TE;Ferguson IT;Morton DL;Burnett MM;Weible JV;Peck JB;Dukes A;McMichael JF;Lolofie JT;Derickson BR;Hundal J;Skidmore ZL;Ainscough BJ;Dees ND;Schierding WS;Kandoth C;Kim KH;Lu C;Harris CC;Maher N;Maher CA;Magrini VJ;Abbott BS;Chen K;Clark E;Das I;Fan X;Hawkins AE;Hepler TG;Wylie TN;Leonard SM;Schroeder WE;Shi X;Carmichael LK;Weil MR;Wohlstadter RW;Stiehr G;McLellan MD;Pohl CS;Miller CA;Koboldt DC;Walker JR;Eldred JM;Larson DE;Dooling DJ;Ding L;Mardis ER;Wilson RK
通讯作者：
Wilson RK