InParanoid 6: eukaryotic ortholog clusters with inparalogs.
InParanoid 6: eukaryotic ortholog clusters with inparalogs.
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非par体6：具有内核的真核直系同源群。
DOI：
10.1093/nar/gkm1020
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发表时间：
2008-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Sonnhammer EL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Berglund AC;Sjölund E;Ostlund G;Sonnhammer EL
内素真核直立性数据库（http://inparanoid.sbc.su.se/）已更新为6版，现在基于35种，我们收集了所有“完整的”真核生物蛋白质组和Escherichia Colle，并计算出矫形器基团。对于所有595种，使用非par虫计划，这将导致2 642 187个基于正交物种的成对直接基团。异素簇包含一个或多个物种中的每个物种中的一个或多个直系同源物。更新系统。
The InParanoid eukaryotic ortholog database (http://InParanoid.sbc.su.se/) has been updated to version 6 and is now based on 35 species. We collected all available ‘complete’ eukaryotic proteomes and Escherichia coli, and calculated ortholog groups for all 595 species pairs using the InParanoid program. This resulted in 2 642 187 pairwise ortholog groups in total. The orthology-based species relations are presented in an orthophylogram. InParanoid clusters contain one or more orthologs from each of the two species. Multiple orthologs in the same species, i.e. inparalogs, result from gene duplications after the species divergence. A new InParanoid website has been developed which is optimized for speed both for users and for updating the system. The XML output format has been improved for efficient processing of the InParanoid ortholog clusters.
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影响因子：
64.8
作者：
Dujon, B;Sherman, D;Souciet, JL
通讯作者：
Souciet, JL
影响因子：
14.9
作者：
Wheeler, David L.;Barrett, Tanya;Yaschenko, Eugene
通讯作者：
Yaschenko, Eugene
DOI：
10.2307/2412448
发表时间：
1970-01-01
期刊：
SYSTEMATIC ZOOLOGY
影响因子：
--
作者：
FITCH, WM
通讯作者：
FITCH, WM
影响因子：
3.7
作者：
Chen F;Mackey AJ;Vermunt JK;Roos DS
通讯作者：
Roos DS
使用功能基因组学数据的基准测试直系同源识别方法。
影响因子：
12.3
作者：
Hulsen T;Huynen MA;de Vlieg J;Groenen PM
通讯作者：
Groenen PM