The Taverna workflow suite: designing and executing workflows of Web Services on the desktop, web or in the cloud.
The Taverna workflow suite: designing and executing workflows of Web Services on the desktop, web or in the cloud.
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DOI：
10.1093/nar/gkt328
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发表时间：
2013-07
影响因子：
14.9
通讯作者：
Goble C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wolstencroft K;Haines R;Fellows D;Williams A;Withers D;Owen S;Soiland-Reyes S;Dunlop I;Nenadic A;Fisher P;Bhagat J;Belhajjame K;Bacall F;Hardisty A;Nieva de la Hidalga A;Balcazar Vargas MP;Sufi S;Goble C
Taverna Workflow工具套件（http://www.taverna.org.uk）旨在将分布式Web服务和/或本地工具组合到复杂的分析管道中。这些管道可以使用Taverna服务器在本地台式机上或通过较大的基础架构（例如超级计算机，网格或云环境）执行。在生物信息学中，小酒馆工作流通常用于高通量法分析（例如蛋白质组学或转录组学）的领域，或用于涉及文本挖掘或数据挖掘的证据收集方法。通过Taverna，科学家可以使用数千种不同的工具和资源，这些工具和资源可以从许多生命科学机构中免费获得。构造后，工作流程可重复使用，可执行的生物信息学协议可以共享，重复使用和重新使用。公共工作流的存储库可在http://www.myexperiment.org上找到。本文提供了Taverna工具套件的更新，重点介绍了Workbench和Taverna服务器中的新功能和开发项目。
The Taverna workflow tool suite (http://www.taverna.org.uk) is designed to combine distributed Web Services and/or local tools into complex analysis pipelines. These pipelines can be executed on local desktop machines or through larger infrastructure (such as supercomputers, Grids or cloud environments), using the Taverna Server. In bioinformatics, Taverna workflows are typically used in the areas of high-throughput omics analyses (for example, proteomics or transcriptomics), or for evidence gathering methods involving text mining or data mining. Through Taverna, scientists have access to several thousand different tools and resources that are freely available from a large range of life science institutions. Once constructed, the workflows are reusable, executable bioinformatics protocols that can be shared, reused and repurposed. A repository of public workflows is available at http://www.myexperiment.org. This article provides an update to the Taverna tool suite, highlighting new features and developments in the workbench and the Taverna Server.
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影响因子：
14.9
作者：
Goujon M;McWilliam H;Li W;Valentin F;Squizzato S;Paern J;Lopez R
通讯作者：
Lopez R
影响因子：
--
作者：
Rybiński M;Lula M;Banasik P;Lasota S;Gambin A
通讯作者：
Gambin A
影响因子：
3
作者：
Stropp T;McPhillips T;Ludäscher B;Bieda M
通讯作者：
Bieda M
DOI：
10.1109/titb.2012.2224666
发表时间：
2013-01-01
影响因子：
7.7
作者：
Goudas, Theodosis;Doukas, Charalampos;Maglogiannis, Ilias
通讯作者：
Maglogiannis, Ilias
影响因子：
14.9
作者：
Hull D;Wolstencroft K;Stevens R;Goble C;Pocock MR;Li P;Oinn T
通讯作者：
Oinn T