Bidirectional processing of pri-miRNAs with branched terminal loops by Arabidopsis Dicer-like1.
Bidirectional processing of pri-miRNAs with branched terminal loops by Arabidopsis Dicer-like1.
复制标题
DOI：
10.1038/nsmb.2646
复制
发表时间：
2013-09
影响因子：
16.8
通讯作者：
Zhang X
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhu H;Zhou Y;Castillo-González C;Lu A;Ge C;Zhao YT;Duan L;Li Z;Axtell MJ;Wang XJ;Zhang X
MiRNAs起源于具有特征的茎环结构的初级转录本(pri-miRNAs)。功能上的miRNAs需要对pri-miRNAs进行准确的处理。在这里，我们以pri-miR166家族为范式，报道了pri-miRNA末端环在miRNA生物发生中的决定性作用。我们发现pri-miR166中的多分支末端环在体内显著抑制了miR166的表达。与pri-miRNAs的规范处理不同，末端环分支(TLBed)pri-miRNAs可以被类DICER 1(DCL1)复合体双向处理：从碱基到环和从环到碱基，分别导致miRNAs的生产性和流行性处理。在任何一种情况下，DCL1复合体都在距离参考单链环区16-17个碱基对(BP)的地方典型地切割pri-miRNAs。DCL1还通过其解旋酶结构域向内部环调整加工位点。因此，这些结果为了解具有复杂二级结构的pri-miRNAs的处理机制提供了新的见解。
miRNAs originate from primary transcripts (pri-miRNAs) with characteristic stem-loop structures. Accurate processing of pri-miRNAs is required for functional miRNAs. Here, using pri-miR166 family as a paradigm, we report the decisive role of pri-miRNA terminal loops in miRNA biogenesis. We found that multi-branched terminal loops in pri-miR166s substantially suppressed miR166 expression in vivo. Unlike canonical processing of pri-miRNAs, terminal-loop-branched (TLBed) pri-miRNAs can be processed by Dicer-like1 (DCL1) complexes bi-directionally: from base to loop and from loop to base, resulting in productive and abortive processing of miRNAs, respectively. In either case, DCL1 complexes canonically cut pri-miRNAs at a distance of 16-17 base pairs (bp) from a reference single-stranded loop region. DCL1 also adjusts processing sites toward an internal loop through its helicase domain. Thus, these results provide new insight into the poorly understood processing mechanism of pri-miRNAs with complicated secondary structures.
登录
查看更多内容
影响因子：
11.8
作者：
Gregory, Brian D.;O'Malley, Ronan C.;Ecker, Joseph R.
通讯作者：
Ecker, Joseph R.
影响因子：
9.2
作者：
Mateos, Julieta L.;Bologna, Nicolas G.;Palatnik, Javier F.
通讯作者：
Palatnik, Javier F.
影响因子：
9.2
作者：
Addo-Quaye, Charles;Eshoo, Tifani W.;Axtell, Michael J.
通讯作者：
Axtell, Michael J.
影响因子：
64.5
作者：
Han, Jinju;Lee, Yoontae;Kim, V. Narry
通讯作者：
Kim, V. Narry
DOI：
10.1126/science.1215691
发表时间：
2012-04-13
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Djuranovic S;Nahvi A;Green R
通讯作者：
Green R