Comments on detecting rogue taxa using RogueNaRok
Comments on detecting rogue taxa using RogueNaRok
复制标题
关于使用 RogueNaRok 检测流氓类群的评论
DOI：
10.1080/14772000.2016.1252440
复制
发表时间：
2016
影响因子：
1.9
通讯作者：
Wilkinson M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wilkinson M
在系统发育分析中，流氓是相对不稳定的分类群，如果它们混淆了更稳定的分类群之间的关系或支持关系，则值得关注。RogueNaRok是最近开发的一种启发式解决方案，用于识别流氓分类群。我们用简单的例子来说明RogueNaRok的性能，旨在澄清它的行为。我们认为，RogueNaRok目前使用的最优性标准有时可能不太适合检测流氓的任务，并且RogueNaRok报告的分数不应被解释为分类单元不稳定性的措施。我们建议如何增强RogueNaRok，并建议不要仅依赖于检测流氓。
Rogues are relatively unstable taxa in phylogenetic analyses that are of concern if they obfuscate relationships, or support for relationships, of interest among more stable taxa. RogueNaRok is a recently developed heuristic solution to the problem of identifying rogue taxa. We illustrate the performance of RogueNaRok with simple examples designed to clarify its behaviour. We argue that the optimality criterion currently used by RogueNaRok may sometimes be poorly suited to the task of detecting rogues and that the scores reported by RogueNaRok should not be interpreted as measures of taxon instability. We suggest how RogueNaRok might be enhanced and recommend that it not be relied upon exclusively for detecting rogues.
通过简化共识识别流氓分类群：NP 难度和精确算法
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
International Symposium on Bioinformatics Research and Applications
影响因子：
--
作者：
A. Deepak;Jianrong Dong;David Fernández
通讯作者：
David Fernández
确定系统发育命名法的稳定参考类群
DOI：
--
发表时间：
2006
期刊：
影响因子：
--
作者：
M. Wilkinson
通讯作者：
M. Wilkinson
有关简化共识方法的更多信息
DOI：
--
发表时间：
1995
期刊：
影响因子：
--
作者：
M. Wilkinson
通讯作者：
M. Wilkinson