Genomic location analysis by ChIP-Seq.
Genomic location analysis by ChIP-Seq.
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DOI：
10.1002/jcb.22077
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发表时间：
2009-05-01
影响因子：
4
通讯作者：
Zhao, Keji
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Barski, Artem;Zhao, Keji
众多转录因子及其他染色质蛋白与基因组的相互作用会影响基因表达，进而影响细胞分化和功能。因此，系统地鉴定转录因子的结合靶点对于解开基因调控网络至关重要。染色质免疫沉淀测序（ChIP - Seq）技术的最新发展使DNA - 蛋白质相互作用的定位发生了革命性变化。现在可以以极高的分辨率在真正的全基因组范围内对蛋白质结合进行定位。这篇综述讨论了ChIP - Seq技术、其可能存在的缺陷、数据分析以及ChIP - Seq技术的一些早期应用。
The interaction of a multitude of transcription factors and other chromatin proteins with the genome can influence gene expression and subsequently cell differentiation and function. Thus systematic identification of binding targets of transcription factors is key to unraveling gene regulation networks. The recent development of ChIP-Seq has revolutionized mapping of DNA-protein interactions. Now protein binding can be mapped in a truly genome-wide manner with extremely high resolution. This review discusses ChIP-Seq technology, its possible pitfalls, data analysis and several early applications of the ChIP-Seq technology.
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影响因子：
64.5
作者：
Cawley, S;Bekiranov, S;Gingeras, TR
通讯作者：
Gingeras, TR
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作者：
Ji, Hongkai;Jiang, Hui;Ma, Wenxiu;Johnson, David S.;Myers, Richard M.;Wong, Wing H.
通讯作者：
Wong, Wing H.
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作者：
Cuddapah, Suresh;Jothi, Raja;Zhao, Keji
通讯作者：
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作者：
Feng W;Liu Y;Wu J;Nephew KP;Huang TH;Li L
通讯作者：
Li L
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作者：
Jothi, Raja;Cuddapah, Suresh;Barski, Artem;Cui, Kairong;Zhao, Keji
通讯作者：
Zhao, Keji