Gene regulatory networks governing pancreas development.
Gene regulatory networks governing pancreas development.
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DOI：
10.1016/j.devcel.2013.03.016
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发表时间：
2013-04-15
影响因子：
11.8
通讯作者：
Kim, Seung K.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Arda, H. Efsun;Benitez, Cecil M.;Kim, Seung K.
阐明控制器官发育的细胞和基因调控网络（GRNs）将加速组织替代的进展。在这里，我们从数据挖掘中汇编了胰腺发育的参考GRNs，该数据挖掘整合了多种方法，包括突变分析，谱系追踪，细胞纯化，基因表达和增强子分析以及基因调控的生化研究。使用已建立的计算工具，我们将这些网络整合并表示为框架，这些框架应该增强对胰腺发育和糖尿病和胰腺癌等疾病的基因组规模遗传和表观遗传研究的激增输出的理解。我们设想类似的方法将有助于了解其他器官的发育。
Elucidation of cellular and gene regulatory networks (GRNs) governing organ development will accelerate progress toward tissue replacement. Here, we have compiled reference GRNs underlying pancreas development from data mining that integrates multiple approaches including mutant analysis, lineage tracing, cell purification, gene expression and enhancer analysis, and biochemical studies of gene regulation. Using established computational tools, we integrated and represented these networks into frameworks that should enhance understanding of the surging output of genomic-scale genetic and epigenetic studies of pancreas development and diseases like diabetes and pancreatic cancer. We envision similar approaches would be useful for understanding development of other organs.
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