Operon prediction by Markov clustering
Operon prediction by Markov clustering
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通过马尔可夫聚类预测操纵子
DOI：
10.1504/ijdmb.2014.062149
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发表时间：
2014-05
影响因子：
0.3
通讯作者：
杜伟
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
杜伟
The prediction of operons is a critical step for the reconstruction of biochemical and regulatory networks at the whole genome level. In this paper, a novel operon prediction model is proposed based on Markov Clustering (MCL). The model employs a graph-clustering method by MCL for prediction and does not need a classifier. In the cross-species validation, the accuracies of E. coli K12, Bacillus subtilis and P. furiosus are 92.1, 86.9 and 87.3%, respectively. Experimental results show that the proposed method has a powerful capability of operon prediction. The compiled program and test data sets are publicly available at http://ccst.jlu.edu.cn/JCSB/OPMC/.
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DOI：
10.1504/ijdmb.2008.020523
发表时间：
2008-09
影响因子：
0.3
作者：
S. Denaxas;Christos Tjortjis
通讯作者：
S. Denaxas;Christos Tjortjis
基于比较基因组分析和基因本体应用的功能模块的预测。
影响因子：
14.9
作者：
Wu, HW;Su, ZC;Mao, FL;Olman, V;Xu, Y
通讯作者：
Xu, Y
影响因子：
14.9
作者：
Price MN;Huang KH;Alm EJ;Arkin AP
通讯作者：
Arkin AP
影响因子：
5.8
作者：
Yada, T;Nakao, M;Nakai, K
通讯作者：
Nakai, K
影响因子：
14.9
作者：
ZUKER, M;STIEGLER, P
通讯作者：
STIEGLER, P