Employing a ZTP Riboswitch to Detect Bacterial Folate Biosynthesis Inhibitors in a Small Molecule High-Throughput Screen.
Employing a ZTP Riboswitch to Detect Bacterial Folate Biosynthesis Inhibitors in a Small Molecule High-Throughput Screen.
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DOI：
10.1021/acschembio.9b00713
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发表时间：
2019-12-20
影响因子：
4
通讯作者：
Breaker RR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Perkins KR;Atilho RM;Moon MH;Breaker RR
人们正在发现各种核糖开关类别，它们可以精确监测重要生物过程的状态，包括代谢途径功能、生理适应信号传导以及对有毒物质的反应。其中一些过程的生化成分可能成为开发新型抗菌分子的极好靶标，可以通过使用表型药物发现（PDD）方法来广泛寻找这些分子。然而，PDD 数据通常不会提供有关每个命中化合物的目标的线索。我们开发并验证了基于 ZTP 核糖开关的强大荧光报告系统，该系统能够以高灵敏度和精确度识别多种叶酸生物合成抑制剂。使用大肠杆菌进行 128,310 种化合物的高通量筛选，评估了基于核糖开关的 PDD 策略的实用性，该筛选在许多初始命中中鉴定了 78 种磺胺衍生物。类似地，其他核糖开关类别的代表也可用于快速将抗菌作用与它们所针对的生物过程相匹配。
Various riboswitch classes are being discovered that precisely monitor the status of important biological processes, including metabolic pathway function, signaling for physiological adaptations, and responses to toxic agents. Biochemical components for some of these processes might make excellent targets for the development of novel antibacterial molecules, which can be broadly sought by using phenotypic drug discovery (PDD) methods. However, PDD data does not normally provide clues regarding the target for each hit compound. We have developed and validated a robust fluorescent reporter system based on a ZTP riboswitch that identifies numerous folate biosynthesis inhibitors with high sensitivity and precision. The utility of the riboswitch-based PDD strategy was evaluated using Escherichia coli bacteria by conducting a 128,310-compound high-throughput screen, which identified 78 sulfanilamide derivatives among the many initial hits. Similarly, representatives of other riboswitch classes could be employed to rapidly match antibacterial hits with the biological processes they target.
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影响因子：
18.3
作者：
Deigan, Katherine E.;Ferre-D'Amare, Adrian R.
通讯作者：
Ferre-D'Amare, Adrian R.
DOI：
10.3390/antibiotics3010001
发表时间：
2014-01-21
期刊：
Antibiotics (Basel, Switzerland)
影响因子：
--
作者：
Bourne CR
通讯作者：
Bourne CR
影响因子：
--
作者：
Ames TD;Rodionov DA;Weinberg Z;Breaker RR
通讯作者：
Breaker RR
正在研发的新型抗生素药物以及它们如何帮助克服微生物耐药性。
影响因子：
5.2
作者：
Gould IM;Bal AM
通讯作者：
Bal AM
影响因子：
16
作者：
Kim PB;Nelson JW;Breaker RR
通讯作者：
Breaker RR