The Blood Proteoform Atlas: A reference map of proteoforms in human hematopoietic cells.
The Blood Proteoform Atlas: A reference map of proteoforms in human hematopoietic cells.
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DOI：
10.1126/science.aaz5284
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发表时间：
2022-01-28
期刊：
影响因子：
56.9
通讯作者：
Kelleher, Neil L.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Melani, Rafael D.;Gerbasi, Vincent R.;Anderson, Lissa C.;Sikora, Jacek W.;Toby, Timothy K.;Hutton, Josiah E.;Butcher, David S.;Negrao, Fernanda;Seckler, Henrique S.;Srzentic, Kristina;Fornelli, Luca;Camarillo, Jeannie M.;LeDuc, Richard D.;Cesnik, Anthony J.;Lundberg, Emma;Greer, Joseph B.;Fellers, Ryan T.;Robey, Matthew T.;DeHart, Caroline J.;Forte, Eleonora;Hendrickson, Christopher L.;Abbatiello, Susan E.;Thomas, Paul M.;Kokaji, Andy, I;Levitsky, Josh;Kelleher, Neil L.
人类生物学与蛋白质紧密相关，但大多数测量方法无法精确确定可变剪接序列或翻译后修饰。在这里，我们展示了约30，000种独特蛋白质的一级结构，比以前的研究多了近10倍，这些蛋白质来自21种细胞类型的1690个人类基因以及来自人类血液和骨髓的血浆。在血液蛋白质组图谱（BPA）中编译的结果表明，蛋白质组更好地描述了蛋白质水平的生物学，并且比其相应的蛋白质更具体的分化指标，这些蛋白质在细胞类型中更广泛地表达。我们证明了临床应用的潜力，通过询问BPA在肝移植的背景下，并确定细胞和蛋白质的签名，区分正常的移植功能从急性排斥反应和其他原因的移植功能障碍。
Human biology is tightly linked to proteins, yet most measurements do not precisely determine alternatively spliced sequences or posttranslational modifications. Here, we present the primary structures of ~30,000 unique proteoforms, nearly 10 times more than in previous studies, expressed from 1690 human genes across 21 cell types and plasma from human blood and bone marrow. The results, compiled in the Blood Proteoform Atlas (BPA), indicate that proteoforms better describe protein-level biology and are more specific indicators of differentiation than their corresponding proteins, which are more broadly expressed across cell types. We demonstrate the potential for clinical application, by interrogating the BPA in the context of liver transplantation and identifying cell and proteoform signatures that distinguish normal graft function from acute rejection and other causes of graft dysfunction.
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影响因子：
3.4
作者：
Brown KA;Melby JA;Roberts DS;Ge Y
通讯作者：
Ge Y
DOI：
10.1126/science.1260793
发表时间：
2015-02-06
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Battle A;Khan Z;Wang SH;Mitrano A;Ford MJ;Pritchard JK;Gilad Y
通讯作者：
Gilad Y
影响因子：
4.4
作者：
Fornelli, Luca;Durbin, Kenneth R.;Kelleher, Neil L.
通讯作者：
Kelleher, Neil L.
DOI：
10.1073/pnas.92.17.7799
发表时间：
1995-08-15
影响因子：
11.1
作者：
GUPTA, SK;HASSEL, T;SINGH, JP
通讯作者：
SINGH, JP
影响因子：
14.9
作者：
UniProt Consortium
通讯作者：
UniProt Consortium