SARS-CoV-2 entry factors are highly expressed in nasal epithelial cells together with innate immune genes.
SARS-CoV-2 entry factors are highly expressed in nasal epithelial cells together with innate immune genes.
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DOI：
10.1038/s41591-020-0868-6
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发表时间：
2020-05
期刊：
影响因子：
82.9
通讯作者：
HCA Lung Biological Network
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Sungnak W;Huang N;Bécavin C;Berg M;Queen R;Litvinukova M;Talavera-López C;Maatz H;Reichart D;Sampaziotis F;Worlock KB;Yoshida M;Barnes JL;HCA Lung Biological Network
我们通过调查来自健康人类供体的多个组织的单细胞RNA-seq数据中病毒进入相关基因的表达来研究SARS-CoV-2的嗜性。我们在特定的呼吸道、角膜和肠上皮细胞中共同检测到这些转录本，这可能解释了SARS-CoV-2传播的高效性。这些基因在鼻上皮细胞中与参与先天免疫的基因共表达，突出了细胞在初始病毒感染、传播和清除中的潜在作用。该研究为进一步调查COVID-19患者的宝贵临床样本提供了有用的资源，我们以全面，开放和用户友好的方式在covid19cellatlas.org上提供我们的数据。
We investigated SARS-CoV-2 tropism by surveying expression of viral entry-associated genes in single-cell RNA-seq data from multiple tissues from healthy human donors. We co-detected these transcripts in specific respiratory, corneal, and intestinal epithelial cells, potentially explaining the high efficiency of SARS-CoV-2 transmission. These genes are co-expressed in nasal epithelial cells with genes involved in innate immunity, highlighting the cells’ potential role in initial viral infection, spread and clearance. The study offers a useful resource for further lines of inquiry with valuable clinical samples from COVID-19 patients, and we provide our data in a comprehensive, open, and user-friendly fashion at covid19cellatlas.org.
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影响因子：
158.5
作者：
Li, Qun;Guan, Xuhua;Feng, Zijian
通讯作者：
Feng, Zijian
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9.3
作者：
Baron M;Veres A;Wolock SL;Faust AL;Gaujoux R;Vetere A;Ryu JH;Wagner BK;Shen-Orr SS;Klein AM;Melton DA;Yanai I
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Yanai I
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作者：
MacParland SA;Liu JC;Ma XZ;Innes BT;Bartczak AM;Gage BK;Manuel J;Khuu N;Echeverri J;Linares I;Gupta R;Cheng ML;Liu LY;Camat D;Chung SW;Seliga RK;Shao Z;Lee E;Ogawa S;Ogawa M;Wilson MD;Fish JE;Selzner M;Ghanekar A;Grant D;Greig P;Sapisochin G;Selzner N;Winegarden N;Adeyi O;Keller G;Bader GD;McGilvray ID
通讯作者：
McGilvray ID
影响因子：
64.8
作者：
Li W;Moore MJ;Vasilieva N;Sui J;Wong SK;Berne MA;Somasundaran M;Sullivan JL;Luzuriaga K;Greenough TC;Choe H;Farzan M
通讯作者：
Farzan M
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44.1
作者：
Guo J;Grow EJ;Mlcochova H;Maher GJ;Lindskog C;Nie X;Guo Y;Takei Y;Yun J;Cai L;Kim R;Carrell DT;Goriely A;Hotaling JM;Cairns BR
通讯作者：
Cairns BR