CRISPR off-target analysis in genetically engineered rats and mice.
CRISPR off-target analysis in genetically engineered rats and mice.
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DOI：
10.1038/s41592-018-0011-5
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发表时间：
2018-07
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Warming S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Anderson KR;Haeussler M;Watanabe C;Janakiraman V;Lund J;Modrusan Z;Stinson J;Bei Q;Buechler A;Yu C;Thamminana SR;Tam L;Sowick MA;Alcantar T;O'Neil N;Li J;Ta L;Lima L;Roose-Girma M;Rairdan X;Durinck S;Warming S
尽管CRISPR被广泛使用，但关于cas9介导的脱靶频率和影响的全面数据在修饰的啮齿动物中是有限的。在这里，我们展示了来自81个小鼠和大鼠基因组编辑项目的深度测序数据以及来自10个小鼠胚胎及其遗传亲本的全基因组测序数据。我们将这些算法的预测能力与GUIDE-seq的改编版本进行了比较，结果表明，eSpCas9（1.1）和Cas9-HF1在体内降低了脱靶突变率。
Despite widespread use of CRISPR, comprehensive data on frequency and impact of Cas9-mediated off-targets in modified rodents is limited. Here, we present deep sequencing data from 81 mouse and rat genome editing projects and whole-genome sequencing data from 10 mouse embryos and their genetic parents. We compared the predictive ability of algorithms to an adapted version of GUIDE-seq, and we show that eSpCas9(1.1) and Cas9-HF1 reduce off-target mutation rates in vivo.
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影响因子：
46.9
作者：
Doench JG;Fusi N;Sullender M;Hegde M;Vaimberg EW;Donovan KF;Smith I;Tothova Z;Wilen C;Orchard R;Virgin HW;Listgarten J;Root DE
通讯作者：
Root DE
影响因子：
46.9
作者：
Tsai, Shengdar Q.;Zheng, Zongli;Nguyen, Nhu T.;Liebers, Matthew;Topkar, Ved V.;Thapar, Vishal;Wyvekens, Nicolas;Khayter, Cyd;Iafrate, A. John;Le, Long P.;Aryee, Martin J.;Joung, J. Keith
通讯作者：
Joung, J. Keith
影响因子：
48
作者：
Crosetto, Nicola;Mitra, Abhishek;Silva, Maria Joao;Bienko, Magda;Dojer, Norbert;Wang, Qi;Karaca, Elif;Chiarle, Roberto;Skrzypczak, Magdalena;Ginalski, Krzysztof;Pasero, Philippe;Rowicka, Maga;Dikic, Ivan
通讯作者：
Dikic, Ivan
DOI：
10.1126/science.aad5227
发表时间：
2016-01-01
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Slaymaker IM;Gao L;Zetsche B;Scott DA;Yan WX;Zhang F
通讯作者：
Zhang F
影响因子：
46.9
作者：
通讯作者：
--