Chromatin conformation signatures of cellular differentiation.
Chromatin conformation signatures of cellular differentiation.
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DOI：
10.1186/gb-2009-10-4-r37
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发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Dostie J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fraser J;Rousseau M;Shenker S;Ferraiuolo MA;Hayashizaki Y;Blanchette M;Dostie J
报道了一套利用5C技术识别全基因组染色质构象特征的计算机程序。基因组学的主要挑战之一是更好地理解正确的基因表达是如何协调的。最近的研究表明，空间染色质组织是如何在基因表达调控的关键。在这里，我们开发了一套计算机程序来识别染色质构象签名与5C技术。我们确定了与细胞分化相关的动态HoxA簇染色质构象特征。全基因组染色质构象特征识别可能唯一地识别疾病相关状态，并代表了一类全新的人类疾病生物标志物。
A suite of computer programs to identify genome-wide chromatin conformation signatures with 5C technology is reported. One of the major genomics challenges is to better understand how correct gene expression is orchestrated. Recent studies have shown how spatial chromatin organization is critical in the regulation of gene expression. Here, we developed a suite of computer programs to identify chromatin conformation signatures with 5C technology . We identified dynamic HoxA cluster chromatin conformation signatures associated with cellular differentiation. Genome-wide chromatin conformation signature identification might uniquely identify disease-associated states and represent an entirely novel class of human disease biomarkers.
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