Global profiling of dynamic protein palmitoylation.
Global profiling of dynamic protein palmitoylation.
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DOI：
10.1038/nmeth.1769
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发表时间：
2011-11-06
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Cravatt, Benjamin F.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Martin, Brent R.;Wang, Chu;Adibekian, Alexander;Tully, Sarah E.;Cravatt, Benjamin F.
棕榈酸在半胱氨酸上的可逆硫酯键被称为蛋白质S-棕榈酰化，其促进蛋白质的膜缔合和适当的亚细胞定位。在这里，我们报告的代谢纳入棕榈酸类似物17-十八炔酸（17-ODYA）结合稳定同位素标记的细胞（SILAC）和脉冲追踪方法，以产生一个全球定量地图的动态蛋白质棕榈酰化事件在细胞中。我们区分稳定棕榈酰化的蛋白质，从那些显示快速营业额。丝氨酸脂肪酶选择性抑制剂的治疗确定了一个特殊的池动态棕榈酰化的蛋白质调节棕榈酰蛋白硫酯酶。这个亚群富含癌基因和其他与异常细胞生长、迁移和癌症相关的蛋白质。我们的方法提供了一种简单的方法来表征细胞中的全局棕榈酰化动力学，并证实酶介导的脱棕榈酰化是快速循环棕榈酰化蛋白质的特定子集的关键调节机制。
The reversible thioester linkage of palmitic acid on cysteines is known as protein S-palmitoylation, which facilitates the membrane association and proper subcellular localization of proteins. Here we report the metabolic incorporation of the palmitic acid analogue 17-octadecynoic acid (17-ODYA) in combination with stable-isotope labeling of cells (SILAC) and pulse-chase methods to generate a global quantitative map of dynamic protein palmitoylation events in cells. We distinguished stably palmitoylated proteins from those that show rapid turnover. Treatment with a serine lipase-selective inhibitor identified a special pool of dynamically palmitoylated proteins regulated by palmitoyl-protein thioesterases. This subset was enriched in oncogenes and other proteins linked to aberrant cell growth, migration, and cancer. Our method provides a straightforward way to characterize global palmitoylation dynamics in cells and confirms enzyme-mediated depalmitoylation as a critical regulatory mechanism for a specific subset of rapidly cycling palmitoylated proteins.
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基于活性的探针，针对蛋白质组中磷脂酶的功能亚类。
影响因子：
15
作者：
Tully, Sarah E.;Cravatt, Benjamin F.
通讯作者：
Cravatt, Benjamin F.
影响因子：
4.8
作者：
Baker, TL;Zheng, H;Buss, JE
通讯作者：
Buss, JE
影响因子：
14.8
作者：
Dekker, Frank J.;Rocks, Oliver;Waldmann, Herbert
通讯作者：
Waldmann, Herbert
影响因子：
14.8
作者：
Adibekian, Alexander;Martin, Brent R.;Wang, Chu;Hsu, Ku-Lung;Bachovchin, Daniel A.;Niessen, Sherry;Hoover, Heather;Cravatt, Benjamin F.
通讯作者：
Cravatt, Benjamin F.
影响因子：
4
作者：
Wennerberg, K;Rossman, KL;Der, CJ
通讯作者：
Der, CJ