Super-enhancer mediated regulation of adult β-globin gene expression: the role of eRNA and Integrator.
Super-enhancer mediated regulation of adult β-globin gene expression: the role of eRNA and Integrator.
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DOI：
10.1093/nar/gkab002
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发表时间：
2021-02-22
影响因子：
14.9
通讯作者：
Bungert J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gurumurthy A;Yu DT;Stees JR;Chamales P;Gavrilova E;Wassel P;Li L;Stribling D;Chen J;Brackett M;Ishov AM;Xie M;Bungert J
超级增强子介导靶基因的高转录水平。先前的研究表明，SEs招募转录复合物并产生增强子rna （eRNAs）。我们在人和鼠的β-珠蛋白基因座控制区（LCR） SE上鉴定了转录。我们发现，在转基因小鼠中，人类LCR能够独立于相关珠蛋白基因募集转录复合物。此外，LCR超敏位点2 （HS2）在转基因小鼠和小鼠红细胞（MEL）细胞内源性β-珠蛋白基因位点启动双向转录物的形成。hs23 ' erna相对不稳定，并保持在接近珠蛋白基因位点。降低hs23 ' erna的丰度导致β-珠蛋白基因转录减少，并损害启动子处RNA聚合酶II （Pol II）的募集。整合子复合体已被证明终止eRNA转录。我们证明了Integrator在LCR HS2下游相互作用。MEL或分化的原代人CD34+细胞中Integrator功能的诱导消融导致成人β-珠蛋白基因表达减少，LCR处Pol II和eRNA的积累。这些数据表明，转录复合物在LCR上组装并通过整合子介导的Pol II和eRNA从LCR释放的机制转移到珠蛋白基因上。
Super-enhancers (SEs) mediate high transcription levels of target genes. Previous studies have shown that SEs recruit transcription complexes and generate enhancer RNAs (eRNAs). We characterized transcription at the human and murine β-globin locus control region (LCR) SE. We found that the human LCR is capable of recruiting transcription complexes independently from linked globin genes in transgenic mice. Furthermore, LCR hypersensitive site 2 (HS2) initiates the formation of bidirectional transcripts in transgenic mice and in the endogenous β-globin gene locus in murine erythroleukemia (MEL) cells. HS2 3′eRNA is relatively unstable and remains in close proximity to the globin gene locus. Reducing the abundance of HS2 3′eRNA leads to a reduction in β-globin gene transcription and compromises RNA polymerase II (Pol II) recruitment at the promoter. The Integrator complex has been shown to terminate eRNA transcription. We demonstrate that Integrator interacts downstream of LCR HS2. Inducible ablation of Integrator function in MEL or differentiating primary human CD34+ cells causes a decrease in expression of the adult β-globin gene and accumulation of Pol II and eRNA at the LCR. The data suggest that transcription complexes are assembled at the LCR and transferred to the globin genes by mechanisms that involve Integrator mediated release of Pol II and eRNA from the LCR.
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影响因子：
30.8
作者：
Allahyar, Amin;Vermeulen, Carlo;de Laat, Wouter
通讯作者：
de Laat, Wouter
DOI：
10.1073/pnas.1324151111
发表时间：
2014-05-20
影响因子：
11.1
作者：
Hsieh, Chen-Lin;Fei, Teng;Kantoff, Philip W.
通讯作者：
Kantoff, Philip W.
影响因子：
16
作者：
Johnson, KD;Christensen, HM;Bresnick, EH
通讯作者：
Bresnick, EH
影响因子：
64.5
作者：
Hnisz D;Abraham BJ;Lee TI;Lau A;Saint-André V;Sigova AA;Hoke HA;Young RA
通讯作者：
Young RA
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影响因子：
64.8
作者：
Cai, Zhaokui;Cao, Changchang;Xue, Yuanchao
通讯作者：
Xue, Yuanchao