Super-enhancers in the control of cell identity and disease.
Super-enhancers in the control of cell identity and disease.
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DOI：
10.1016/j.cell.2013.09.053
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发表时间：
2013-11-07
期刊：
影响因子：
64.5
通讯作者：
Young RA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hnisz D;Abraham BJ;Lee TI;Lau A;Saint-André V;Sigova AA;Hoke HA;Young RA
超级增强子是大簇的转录增强子，其驱动定义细胞身份的基因的表达。通过了解构成这些结构域的因子的星座，并通过在人类细胞类型的光谱中识别超级增强子，可以更好地理解超级增强子在生物学中的作用。我们在这里描述的人口的转录因子，辅因子，染色质调节和转录装置占用超增强子在胚胎干细胞和证据表明，超增强子是高度转录。我们在广泛的人类细胞类型中产生了一系列超级增强子，并发现超级增强子与控制和定义这些细胞生物学的基因相关。有趣的是，疾病相关的变异特别富集在疾病相关细胞类型的超级增强子中。此外，我们发现癌细胞在癌基因和其他在肿瘤发病机制中重要的基因上产生超级增强子。因此，超级增强子在健康和疾病中的人类细胞身份中发挥关键作用。
Super-enhancers are large clusters of transcriptional enhancers that drive expression of genes that define cell identity. Improved understanding of the roles super-enhancers play in biology would be afforded by knowing the constellation of factors that constitute these domains and by identifying super-enhancers across the spectrum of human cell types. We describe here the population of transcription factors, cofactors, chromatin regulators and transcription apparatus occupying super-enhancers in embryonic stem cells and evidence that super-enhancers are highly transcribed. We produce a catalogue of super-enhancers in a broad range of human cell types, and find that super-enhancers associate with genes that control and define the biology of these cells. Interestingly, disease-associated variation is especially enriched in the super-enhancers of disease-relevant cell types. Furthermore, we find that cancer cells generate super-enhancers at oncogenes and other genes important in tumor pathogenesis. Thus, super-enhancers play key roles in human cell identity in health and disease.
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影响因子：
16
作者：
Calo, Eliezer;Wysocka, Joanna
通讯作者：
Wysocka, Joanna
影响因子：
64.8
作者：
Heintzman, Nathaniel D.;Hon, Gary C.;Hawkins, R. David;Kheradpour, Pouya;Stark, Alexander;Harp, Lindsey F.;Ye, Zhen;Lee, Leonard K.;Stuart, Rhona K.;Ching, Christina W.;Ching, Keith A.;Antosiewicz-Bourget, Jessica E.;Liu, Hui;Zhang, Xinmin;Green, Roland D.;Lobanenkov, Victor V.;Stewart, Ron;Thomson, James A.;Crawford, Gregory E.;Kellis, Manolis;Ren, Bing
通讯作者：
Ren, Bing
影响因子：
64.5
作者：
Cherry AB;Daley GQ
通讯作者：
Daley GQ
DOI：
10.1038/nrrheum.2010.176
发表时间：
2010-12
期刊：
Nature reviews. Rheumatology
影响因子：
--
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
5.9
作者：
Dowen, Jill M.;Bilodeau, Steve;Young, Richard A.
通讯作者：
Young, Richard A.