Structural biology of the purine biosynthetic pathway.
Structural biology of the purine biosynthetic pathway.
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DOI：
10.1007/s00018-008-8295-8
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发表时间：
2008-11
影响因子：
8
通讯作者：
Ealick, S. E.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhang, Y.;Morar, M.;Ealick, S. E.
嘌呤生物合成需要十个酶促转化以产生肌苷一磷酸。PurF、PurD、PurL、PurM、PurC和PurB是所有途径共有的，而PurN或PurT、PurK/PurE-I或PurE-II、PurH或PurP以及PurJ或PurO在不同生物体中催化相同的步骤。所有15种嘌呤生物合成酶的X射线晶体结构都是可用的，包括7种ATP依赖性酶，2种酰胺转移酶和2种四氢叶酸依赖性酶。在这里，我们总结了嘌呤生物合成酶的结构，讨论了相似性和差异，并提出了途径进化的论点。其中四种ATP依赖酶属于ATP-抓握超家族，两种属于PurM超家族。酰胺基转移酶是不相关的，其中一种利用NTN-转氨酶，另一种利用三联体转氨酶。同样，四氢叶酸依赖酶也是不相关的。祖先蛋白质可能包括广泛的特异性酶而不是PurD、PurT、PurK、PurC和PurP，以及单独的酶而不是PurM和PurL。
Purine biosynthesis requires ten enzymatic transformations to generate inosine monophosphate. PurF, PurD, PurL, PurM, PurC, and PurB are common to all pathways, while PurN or PurT, PurK/PurE-I or PurE-II, PurH or PurP, and PurJ or PurO catalyze the same steps in different organisms. X-ray crystal structures are available for all 15 purine biosynthetic enzymes, including seven ATP-dependent enzymes, two amidotransferases and two tetrahydrofolate-dependent enzymes. Here we summarize the structures of the purine biosynthetic enzymes, discuss similarities and differences, and present arguments for pathway evolution. Four of the ATP-dependent enzymes belong to the ATP-grasp superfamily and two to the PurM superfamily. The amidotransferases are unrelated with one utilizing an NTN-glutaminase and the other utilizing a triad glutaminase. Likewise the tetrahydrofolate-dependent enzymes are unrelated. Ancestral proteins may have included a broad specificity enzyme instead of PurD, PurT, PurK, PurC, and PurP, and a separate enzyme instead of PurM and PurL.
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影响因子：
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作者：
Chumanevich, AA;Krupenko, SA;Davies, C
通讯作者：
Davies, C
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4.8
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通讯作者：
Honzatko, Richard B.
DOI：
10.1107/s0907444904019158
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2004-12-01
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10.1073/pnas.87.8.3097
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1990-04-01
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CHEN, ZD;DIXON, JE;ZALKIN, H
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