Phenotypic profiling of the human genome by time-lapse microscopy reveals cell division genes.
Phenotypic profiling of the human genome by time-lapse microscopy reveals cell division genes.
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尽管我们对人类基因组的了解迅速增长，但我们并不知晓生命一些最基本功能所需的所有基因。为了开始填补这一空白，我们开发了一种高通量表型筛选平台，它结合了RNA干扰的高效基因沉默、延时显微镜技术以及计算机图像处理技术。我们通过对荧光标记染色体进行为期两天的实时成像，对大约21,000个人类蛋白质编码基因中的每一个进行了全基因组表型分析。通过计算机图像处理对表型进行定量评分，这使我们能够识别出数百个涉及多种生物学功能（包括细胞分裂、迁移和存活）的人类基因。作为Mitocheck联盟的一部分，这项研究对细胞分裂表型进行了深入分析，并将整个高内涵数据集作为一种资源提供给相关领域。
Despite our rapidly growing knowledge about the human genome, we do not know all of the genes required for some of the most basic functions of life. To start to fill this gap we developed a high-throughput phenotypic screening platform combining potent gene silencing by RNA interference, time-lapse microscopy and computational image processing. We carried out a genome-wide phenotypic profiling of each of the ~21,000 human protein-coding genes by two-day live imaging of fluorescently labelled chromosomes. Phenotypes were scored quantitatively by computational image processing, which allowed us to identify hundreds of human genes involved in diverse biological functions including cell division, migration and survival. As part of the Mitocheck consortium, this study provides an in-depth analysis of cell division phenotypes and makes the entire high-content data set available as a resource to the community.
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DOI：
10.1073/pnas.0409861102
发表时间：
2005-02-15
影响因子：
11.1
作者：
Kittler, R;Pelletier, L;Buchholz, F
通讯作者：
Buchholz, F
影响因子：
21.3
作者：
Kittler, Ralf;Pelletier, Laurence;Buchholz, Frank
通讯作者：
Buchholz, Frank
影响因子：
9.2
作者：
Sumara, I;Giménez-Abián, JF;Peters, JM
通讯作者：
Peters, JM
影响因子：
3.5
作者：
Liebel, U;Starkuviene, V;Pepperkok, R
通讯作者：
Pepperkok, R
NUSAP是一种与有丝分裂纺锤体组织有关的新型微管相关蛋白。
影响因子：
7.8
作者：
Raemaekers, Tim;Ribbeck, Katharina;Beaudouin, Joel;Annaert, Wim;Van Camp, Mark;Stockmans, Ingrid;Smets, Nico;Bouillon, Roger;Ellenberg, Jan;Carmeliet, Geert
通讯作者：
Carmeliet, Geert