No coexistence for free: neutral null models for multistrain pathogens.
No coexistence for free: neutral null models for multistrain pathogens.
复制标题
DOI：
10.1016/j.epidem.2008.07.001
复制
发表时间：
2009-03
期刊：
影响因子：
3.8
通讯作者：
Fraser, Christophe
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lipsitch, Marc;Colijn, Caroline;Cohen, Ted;Hanage, William P.;Fraser, Christophe
关键词：
在大多数病原体中，多种菌株维持在宿主群体中。量化菌株共存的潜在机制将有助于公共卫生规划和提高对疾病动力学的理解。我们认为，菌株共存的数学模型，当应用于无法区分的菌株，应符合生态中立和人口遗传中立的标准。我们表明，封闭的克隆传播模型，可以写在一个“祖先追踪”的形式，满足前一个标准也将满足后者。中性模型可以是一个吝啬的起点，研究机制的应变共存，对过去和未来的研究进行了讨论。
In most pathogens, multiple strains are maintained within host populations. Quantifying the mechanisms underlying strain coexistence would aid public health planning and improve understanding of disease dynamics. We argue that mathematical models of strain coexistence, when applied to indistinguishable strains, should meet criteria for both ecological neutrality and population genetic neutrality. We show that closed clonal transmission models which can be written in an “ancestor-tracing” form that meets the former criterion will also satisfy the latter. Neutral models can be a parsimonious starting point for studying mechanisms of strain coexistence; implications for past and future studies are discussed.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1073/pnas.0406993102
发表时间：
2005-02-08
影响因子：
11.1
作者：
Fraser, C;Hanage, WP;Spratt, BG
通讯作者：
Spratt, BG
影响因子：
56.9
作者：
Gupta, S;Ferguson, N;Anderson, R
通讯作者：
Anderson, R
影响因子：
3.1
作者：
Dawid, Suzanne;Roche, Aoife M.;Weiser, Jeffrey N.
通讯作者：
Weiser, Jeffrey N.
影响因子：
64.8
作者：
Ferguson, NM;Galvani, AP;Bush, RM
通讯作者：
Bush, RM
影响因子：
6.4
作者：
Feikin, DR;Dowell, SF;Schwartz, B
通讯作者：
Schwartz, B