Isolate-Based Surveillance of Bordetella pertussis, Austria, 2018-2020.
Isolate-Based Surveillance of Bordetella pertussis, Austria, 2018-2020.
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2018-2020年奥地利百日咳杆菌隔离监测。
DOI：
10.3201/eid2703.202314
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发表时间：
2021-03
影响因子：
11.8
通讯作者：
Ruppitsch W
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cabal A;Schmid D;Hell M;Chakeri A;Mustafa-Korninger E;Wojna A;Stöger A;Möst J;Leitner E;Hyden P;Rattei T;Habington A;Wiedermann U;Allerberger F;Ruppitsch W
百日咳是一种疫苗可预防的疾病，它最近的死灰复燃可能是由于出现了与疫苗毒株不同的基因毒株。我们描述了一种新的基于分离的百日咳监测系统和核心基因组多位点序列分型方案，以评估百日咳杆菌的遗传变异性，并调查奥地利百日咳发病率的增加。在2018-2020年间，我们获得了123株百日咳杆菌分离株，并用新的方案进行了分型(2983个目标和6个等位基因的初步聚类阈值)。奥地利的百日咳杆菌分离株在核心基因组和疫苗抗原基因上都与疫苗株存在遗传差异；31.7%的分离株缺乏百日咳蛋白。我们检测到8个聚集性，其中1个带有Pertactin缺陷分离物，可能是局部暴发的一部分。需要在全国推广隔离监测系统，以实施百日咳控制战略。
Pertussis is a vaccine-preventable disease, and its recent resurgence might be attributable to the emergence of strains that differ genetically from the vaccine strain. We describe a novel pertussis isolate-based surveillance system and a core genome multilocus sequence typing scheme to assess Bordetella pertussis genetic variability and investigate the increased incidence of pertussis in Austria. During 2018–2020, we obtained 123 B. pertussis isolates and typed them with the new scheme (2,983 targets and preliminary cluster threshold of <6 alleles). B. pertussis isolates in Austria differed genetically from the vaccine strain, both in their core genomes and in their vaccine antigen genes; 31.7% of the isolates were pertactin-deficient. We detected 8 clusters, 1 of them with pertactin-deficient isolates and possibly part of a local outbreak. National expansion of the isolate-based surveillance system is needed to implement pertussis-control strategies.
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