SOT1, a pentatricopeptide repeat protein with a small MutS-related domain, is required for correct processing of plastid 23S-4.5S rRNA precursors in Arabidopsis thaliana.
SOT1, a pentatricopeptide repeat protein with a small MutS-related domain, is required for correct processing of plastid 23S-4.5S rRNA precursors in Arabidopsis thaliana.
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SOT1 是一种具有小 MutS 相关结构域的五肽重复蛋白，是拟南芥中质体 23S-4.5S rRNA 前体的正确加工所必需的。
DOI：
10.1111/tpj.13126
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发表时间：
2016-03
期刊：
影响因子：
7.2
通讯作者：
Huang Jirong
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wu Wenjuan;Liu Sheng;Ruwe Hannes;Zhang Delin;Melonek Joanna;Zhu Yajuan;Hu Xupeng;Gusewski S;ra;Yin Ping;Small Ian D;Howell Katharine A;Huang Jirong
核糖体 RNA 加工对于质体核糖体生物发生至关重要，但在高等植物中仍知之甚少。在这里，我们发现类囊体形成抑制因子 1 (SOT1) 是一种质体定位的五肽重复 (PPR) 蛋白，具有小的 MutS 相关结构域，是 23S-4.5S rRNA 双顺反子成熟所必需的。 SOT1 功能丧失会导致叶绿体发育减慢、叶片杂色抑制以及 23S 和 4.5S 加工异常。基于 PPR 基序序列的预测将 23S-4.5S rRNA 双顺反子前体的 5' 端识别为假定的 SOT1 结合位点。这通过电泳迁移率变动测定以及 sot1 突变体中与该位点相关的丰富小 RNA“足迹”的丧失得到证实。我们发现 sot1 突变体中超过一半的 23S-4.5S rRNA 双顺反子包含被侵蚀和/或未加工的 5' 和 3' 末端，并且通常从前体 5' 末端释放的内切核酸切割产物在 sot1 无效突变体中不存在。我们假设 SOT1 结合可保护 23S-4.5S rRNA 双顺反子的 5' 末端免受核酸外切攻击，并有利于形成允许对其 5' 和 3' 末端进行核酸内切加工的 RNA 结构。
Ribosomal RNA processing is essential for plastid ribosome biogenesis, but is still poorly understood in higher plants. Here, we show that SUPPRESSOR OF THYLAKOID FORMATION1 (SOT1), a plastid-localized pentatricopeptide repeat (PPR) protein with a small MutS-related domain, is required for maturation of the 23S-4.5S rRNA dicistron. Loss of SOT1 function leads to slower chloroplast development, suppression of leaf variegation, and abnormal 23S and 4.5S processing. Predictions based on the PPR motif sequences identified the 5' end of the 23S-4.5S rRNA dicistronic precursor as a putative SOT1 binding site. This was confirmed by electrophoretic mobility shift assay, and by loss of the abundant small RNA 'footprint' associated with this site in sot1 mutants. We found that more than half of the 23S-4.5S rRNA dicistrons in sot1 mutants contain eroded and/or unprocessed 5' and 3' ends, and that the endonucleolytic cleavage product normally released from the 5' end of the precursor is absent in a sot1 null mutant. We postulate that SOT1 binding protects the 5' extremity of the 23S-4.5S rRNA dicistron from exonucleolytic attack, and favours formation of the RNA structure that allows endonucleolytic processing of its 5' and 3' ends.
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RNR1，一种属于RNR超家族的3'-5'驱虫核酸酶，在拟南芥中催化3'叶绿体核糖体RNA成熟。
影响因子：
14.9
作者：
Bollenbach, TJ;Lange, H;Gutierrez, R;Erhardt, M;Stern, DB;Gagliardi, D
通讯作者：
Gagliardi, D
影响因子：
48
作者：
Langmead, Ben;Salzberg, Steven L.
通讯作者：
Salzberg, Steven L.
DOI：
10.4061/2011/691735
发表时间：
2011
期刊：
Molecular biology international
影响因子：
--
作者：
Fukui K;Kuramitsu S
通讯作者：
Kuramitsu S
DOI：
10.1093/emboj/cdf686
发表时间：
2002-12
期刊：
The EMBO Journal
影响因子：
--
作者：
Michael Walter;Joachim Kilian;J. Kudla
通讯作者：
Michael Walter;Joachim Kilian;J. Kudla
影响因子：
4.4
作者：
de Jong A;Pietersma H;Cordes M;Kuipers OP;Kok J
通讯作者：
Kok J