NNcon: improved protein contact map prediction using 2D-recursive neural networks.

NNcon: improved protein contact map prediction using 2D-recursive neural networks.
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DOI:
10.1093/nar/gkp305
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发表时间:
2009-07
影响因子:
14.9
通讯作者:
Cheng J
Cheng J
中科院分区:
生物学2区
文献类型:
--
作者:
Tegge AN;Wang Z;Eickholt J;Cheng J

文献摘要

参考文献

被引文献

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蛋白质接触图预测对于蛋白质折叠速率预测、模型选择和三维结构预测具有重要意义。在这里,我们描述了NNcon,一个快速可靠的接触图预测服务器和软件。NNcon在2008年蛋白质结构预测技术第八次关键评估(CASP8)中被评为最准确的残基接触预测因子之一。NNcon服务器和软件都可以在http://casp.rnet.missouri.edu/nncon.html上找到。
Protein contact map prediction is useful for protein folding rate prediction, model selection and 3D structure prediction. Here we describe NNcon, a fast and reliable contact map prediction server and software. NNcon was ranked among the most accurate residue contact predictors in the Eighth Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP8), 2008. Both NNcon server and software are available at http://casp.rnet.missouri.edu/nncon.html.
DOI: 10.1093/nar/gki396
发表时间: 2005-07-01
影响因子: 14.9
作者:
Cheng, J;Randall, AZ;Sweredoski, MJ;Baldi, P
通讯作者: Baldi, P
DOI: 10.1016/s0959-440x(02)00333-0
发表时间: 2002-06-01
影响因子: 6.8
作者:
Valencia, A;Pazos, F
通讯作者: Pazos, F
DOI: 10.1093/bioinformatics/btn115
发表时间: 2008-05-15
期刊: BIOINFORMATICS
影响因子: 5.8
作者:
Vassura, Marco;Margara, Luciano;Casadio, Rita
通讯作者: Casadio, Rita
DOI: 10.1093/bioinformatics/btn248
发表时间: 2008-07-15
期刊: Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子: --
作者:
Miller CS;Eisenberg D
通讯作者: Eisenberg D
DOI: 10.1186/1471-2105-7-503
发表时间: 2006-11-16
期刊: BMC bioinformatics
影响因子: 3
作者:
Kundrotas PJ;Alexov EG
通讯作者: Alexov EG