Programming nanopore ion flow for encoded multiplex microRNA detection.
Programming nanopore ion flow for encoded multiplex microRNA detection.
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DOI：
10.1021/nn406339n
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发表时间：
2014-04-22
期刊：
影响因子：
17.1
通讯作者：
Gu LQ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhang X;Wang Y;Fricke BL;Gu LQ
在将纳米孔转化为用于各种遗传和表观遗传检测的超灵敏单分子平台方面，正在做出许多努力。然而，与目前包括PCR在内的方法相比，低吞吐量限制了纳米孔在生物研究和临床环境中的应用，这通常需要同时检测多个生物标志物才能准确诊断疾病。在这里，我们报告了一种条形码探针方法，用于在一个纳米孔中检测多个核酸。我们没有直接识别纳米孔中的不同目标，而是设计了一系列条形码探针来编码不同的目标。当探针与靶结合时，通过点击化学附着在探针上的条形码基团聚乙二醇能特异性地调制纳米孔离子流。得到的签名用作编码目标的标记。因此，对电流记录中的不同特征进行计数允许同时分析一个纳米孔中的多个目标。这种方法的原理是通过使用一组来自癌症的microRNAs作为靶标来验证的，这是一种用于癌症检测的生物标志物。
Many efforts are being made in translating the nanopore into an ultrasensitive single-molecule platform for various genetic and epigenetic detections. However, compared with current approaches including PCR, the low throughput limits the nanopore applications in biological research and clinical settings, which usually requires simultaneous detection of multiple biomarkers for accurate disease diagnostics. Herein we report a barcode probe approach for multiple nucleic acid detection in one nanopore. Instead of directly identifying different targets in a nanopore, we designed a series of barcode probes to encode different targets. When the probe is bound with the target, the barcode group polyethylene glycol attached on the probe through click chemistry can specifically modulate nanopore ion flow. The resulting signature serves as a marker for the encoded target. Therefore counting different signatures in a current recording allows simultaneous analysis of multiple targets in one nanopore. The principle of this approach was verified by using a panel of cancer-derived microRNAs as the target, a type of biomarker for cancer detection.
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影响因子：
--
作者：
Bayley H;Cronin B;Heron A;Holden MA;Hwang WL;Syeda R;Thompson J;Wallace M
通讯作者：
Wallace M
影响因子：
7.4
作者：
Gao, Changlu;Ding, Shu;Tan, Qiulin;Gu, Li-Qun
通讯作者：
Gu, Li-Qun
DOI：
10.1158/1078-0432.ccr-09-1736
发表时间：
2010-01-15
期刊：
Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
影响因子：
--
作者：
Landi MT;Zhao Y;Rotunno M;Koshiol J;Liu H;Bergen AW;Rubagotti M;Goldstein AM;Linnoila I;Marincola FM;Tucker MA;Bertazzi PA;Pesatori AC;Caporaso NE;McShane LM;Wang E
通讯作者：
Wang E
影响因子：
46.9
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
10.8
作者：
Kowalczyk, Stefan W.;Hall, Adam R.;Dekker, Cees
通讯作者：
Dekker, Cees