ggtreeExtra: Compact Visualization of Richly Annotated Phylogenetic Data.
ggtreeExtra: Compact Visualization of Richly Annotated Phylogenetic Data.
复制标题
GgtreeExtra：丰富注释的系统发育数据的紧凑可视化。
DOI：
10.1093/molbev/msab166
复制
发表时间：
2021-08-23
影响因子：
10.7
通讯作者：
Yu G
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Xu S;Dai Z;Guo P;Fu X;Liu S;Zhou L;Tang W;Feng T;Chen M;Zhan L;Wu T;Hu E;Jiang Y;Bo X;Yu G
我们提出了ggtreeExtra软件包，用于在圆形或矩形布局中使用系统发育树可视化异质数据（https：//www.bioconductor.org/packages/ggtreeExtra）。该软件包支持比其他工具更多的数据类型和可视化方法。它支持使用图形语法的语法在具有丰富注释层的树上呈现数据，并允许通过常用软件推断的进化统计与外部数据集成和可视化。GgtreeExtra是一个通用的树木数据可视化工具。它扩展了系统发育树在不同学科中的应用，使更多的特定领域的数据可用于可视化和解释的进化背景。
We present the ggtreeExtra package for visualizing heterogeneous data with a phylogenetic tree in a circular or rectangular layout (https://www.bioconductor.org/packages/ggtreeExtra). The package supports more data types and visualization methods than other tools. It supports using the grammar of graphics syntax to present data on a tree with richly annotated layers and allows evolutionary statistics inferred by commonly used software to be integrated and visualized with external data. GgtreeExtra is a universal tool for tree data visualization. It extends the applications of the phylogenetic tree in different disciplines by making more domain-specific data to be available to visualize and interpret in the evolutionary context.
登录
查看更多内容
影响因子：
28.3
作者：
Helfrich EJN;Vogel CM;Ueoka R;Schäfer M;Ryffel F;Müller DB;Probst S;Kreuzer M;Piel J;Vorholt JA
通讯作者：
Vorholt JA
影响因子：
12.3
作者：
Gentleman RC;Carey VJ;Bates DM;Bolstad B;Dettling M;Dudoit S;Ellis B;Gautier L;Ge Y;Gentry J;Hornik K;Hothorn T;Huber W;Iacus S;Irizarry R;Leisch F;Li C;Maechler M;Rossini AJ;Sawitzki G;Smith C;Smyth G;Tierney L;Yang JY;Zhang J
通讯作者：
Zhang J
影响因子：
6.6
作者：
Yu, Guangchuang;Smith, David K.;Lam, Tommy Tsan-Yuk
通讯作者：
Lam, Tommy Tsan-Yuk
影响因子：
64.8
作者：
Bai, Yang;Mueller, Daniel B.;Schulze-Lefert, Paul
通讯作者：
Schulze-Lefert, Paul
影响因子：
10.7
作者：
Yu, Guangchuang;Lam, Tommy Tsan-Yuk;Guan, Yi
通讯作者：
Guan, Yi