Punctuated evolution of prostate cancer genomes.
Punctuated evolution of prostate cancer genomes.
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DOI：
10.1016/j.cell.2013.03.021
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发表时间：
2013-04-25
期刊：
影响因子：
64.5
通讯作者：
Garraway LA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Baca SC;Prandi D;Lawrence MS;Mosquera JM;Romanel A;Drier Y;Park K;Kitabayashi N;MacDonald TY;Ghandi M;Van Allen E;Kryukov GV;Sboner A;Theurillat JP;Soong TD;Nickerson E;Auclair D;Tewari A;Beltran H;Onofrio RC;Boysen G;Guiducci C;Barbieri CE;Cibulskis K;Sivachenko A;Carter SL;Saksena G;Voet D;Ramos AH;Winckler W;Cipicchio M;Ardlie K;Kantoff PW;Berger MF;Gabriel SB;Golub TR;Meyerson M;Lander ES;Elemento O;Getz G;Demichelis F;Rubin MA;Garraway LA
对前列腺癌外显子DNA的分析已经确定了复发突变的基因，但在这种疾病中，全基因组改变的谱还没有被广泛描述。我们对57个前列腺肿瘤的基因组进行了测序，并匹配了正常组织，以表征体细胞改变，并研究它们在肿瘤发生和发展过程中如何积累。通过对基因组重排的起源进行建模，我们确定了大量的DNA易位和缺失，它们以高度相互依赖的方式出现。这种现象，我们称之为“染色体畸变”，经常解释前列腺癌基因的失调，并似乎协调地破坏多个癌症基因。我们的模型表明，在前列腺癌和其他肿瘤的相对较少的事件中，染色体可能会诱导相当大的基因组紊乱，支持间断性癌症演变的模型。通过描述前列腺肿瘤中基因组病变的克隆层次，我们绘制了一条致癌事件的路径，沿着该路径，染色体可能驱动前列腺癌的发生。
The analysis of exonic DNA from prostate cancers has identified recurrently mutated genes, but the spectrum of genome-wide alterations has not been profiled extensively in this disease. We sequenced the genomes of 57 prostate tumors and matched normal tissues to characterize somatic alterations and to study how they accumulate during oncogenesis and progression. By modeling the genesis of genomic rearrangements, we identified abundant DNA translocations and deletions that arise in a highly interdependent manner. This phenomenon, which we term “chromoplexy”, frequently accounts for the dysregulation of prostate cancer genes and appears to disrupt multiple cancer genes coordinately. Our modeling suggests that chromoplexy may induce considerable genomic derangement over relatively few events in prostate cancer and other neoplasms, supporting a model of punctuated cancer evolution. By characterizing the clonal hierarchy of genomic lesions in prostate tumors, we charted a path of oncogenic events along which chromoplexy may drive prostate carcinogenesis.
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