Proteomic data set of the organohalide-respiring Epsilonproteobacterium Sulfurospirillum multivorans adapted to tetrachloroethene and other energy substrates
Proteomic data set of the organohalide-respiring Epsilonproteobacterium Sulfurospirillum multivorans adapted to tetrachloroethene and other energy substrates
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适应四氯乙烯和其他能源底物的有机卤化物呼吸 Epsilonproteobacter Sulfurospirillum multivorans 的蛋白质组数据集
DOI：
10.1016/j.dib.2016.06.022
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发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
1.2
通讯作者：
Jehmlich N
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Goris T;Schiffmann CL;Gadkari J;Adrian L;von Bergen M;Diekert G;Jehmlich N
Sulfurospirillum multivoransis 是一种自由生活、生理上多功能的 Epsilonproteobacteria，能够将氯化和溴化乙烯的还原脱卤与生长（有机卤化物呼吸）结合起来。我们提供了 S 的蛋白质组数据。多噬菌体使用不同的电子供体（甲酸盐或丙酮酸盐）和电子受体（富马酸盐、硝酸盐或四氯乙烯 [PCE]）生长。为了获得有关蛋白质细胞定位的信息，在从两个组分收集数据之前将膜提取物和可溶性组分分离。 S的蛋白质组分析。 multivorans 通过质谱法 (nanoLC-MS/MS) 进行。原始数据已存放在 ProteomeXchange，“ProteomeXchange 提供全球协调的蛋白质组学数据提交和传播”[1]，通过 PRIDE 合作伙伴存储库（数据集标识符 PRIDE：PXD004011）。这些数据可能支持有机卤化物呼吸和自由生活的ε变形菌一般代谢的进一步研究。该数据集与之前发表的一项研究“适应四氯乙烯和其他能量底物的有机卤化物呼吸 EpsilonproteobacteriaS. multivorans 的蛋白质组学”相关[2]。
Sulfurospirillum multivoransis a free-living, physiologically versatile Epsilonproteobacterium able to couple the reductive dehalogenation of chlorinated and brominated ethenes to growth (organohalide respiration). We present proteomic data ofS. multivoransgrown with different electron donors (formate or pyruvate) and electron acceptors (fumarate, nitrate, or tetrachloroethene [PCE]). To obtain information on the cellular localization of proteins, membrane extracts and soluble fractions were separated before data collection from both fractions. The proteome analysis ofS. multivoranswas performed by mass spectrometry (nanoLC-MS/MS). Raw data have been deposited at ProteomeXchange, “ProteomeXchange provides globally coordinated proteomics data submission and dissemination” [1], via the PRIDE partner repository with the dataset identifier PRIDE: PXD004011. The data might support further research in organohalide respiration and in the general metabolism of free-living Epsilonproteobacteria. The dataset is associated with a previously published study “Proteomics of the organohalide-respiring EpsilonproteobacteriumS. multivoransadapted to tetrachloroethene and other energy substrates” [2].
0kajima, T 等人：“小鼠 GD la/Gtlaa/Gqlba 合酶 (ST6GalNAcVH1) 基因的分子克隆和表达。”J.
DOI：
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发表时间：
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期刊：
影响因子：
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作者：
通讯作者：
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影响因子：
4.6
作者：
Goris T;Schiffmann CL;Gadkari J;Schubert T;Seifert J;Jehmlich N;von Bergen M;Diekert G
通讯作者：
Diekert G