Comparison of transcription regulatory interactions inferred from high-throughput methods: what do they reveal?
Comparison of transcription regulatory interactions inferred from high-throughput methods: what do they reveal?
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从高通量方法推断的转录调控相互作用的比较：它们揭示了什么？
DOI：
10.1016/j.tig.2008.04.006
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发表时间：
2008-07
影响因子：
11.4
通讯作者：
Aravind, L.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Balaji, S.;Iyer, Lakshminarayan M.;Babu, M. Madan;Aravind, L.
我们比较了三种高通量方法推断的转录调控相互作用。由于这些方法利用不同的原理，它们几乎没有共同的作用，这表明它们捕获了实际转录调控程序的不同方面。此外，我们还表明，这些方法捕获了不同的生物学现象，包括端粒和转录因子之间的远程相互作用，干扰核糖体生物发生的下游效应，以及蛋白质聚集反应。通过对后者的详细分析，我们预测了系统响应蛋白质聚集压力的组件。
We compared the inferred transcription regulatory interactions from three high-throughput methods. As these methods utilize different principles, they have few interactions in common, suggesting that they capture distinct facets of the actual transcription regulatory program. In addition, we show that these methods capture disparate biological phenomena, which include long-range interactions between telomeres and transcription factors, downstream effects of interference with ribosome biogenesis and a protein-aggregation response. Through a detailed analysis of the latter we predict components of the system responding to protein-aggregation stress.
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DOI：
10.1073/pnas.1133288100
发表时间：
2003-08-05
影响因子：
11.1
作者：
Wilson, MA;Collins, JL;Petsko, GA
通讯作者：
Petsko, GA
DOI：
10.1073/pnas.0605140103
发表时间：
2006-08-08
影响因子：
11.1
作者：
Chua, Gordon;Morris, Quaid D.;Hughes, Timothy R.
通讯作者：
Hughes, Timothy R.
影响因子：
56.9
作者：
Lee, TI;Rinaldi, NJ;Young, RA
通讯作者：
Young, RA
DOI：
10.1098/rstb.2005.1806
发表时间：
2006-03-29
影响因子：
6.3
作者：
Schlitt, T;Brazma, A
通讯作者：
Brazma, A
影响因子：
30.8
作者：
Guelzim, N;Bottani, S;Képès, F
通讯作者：
Képès, F