X-ray Determination of Protein and Viruses

蛋白质和病毒的 X 射线测定

• 批准号: 9102855
• 负责人: Michael Rossmann
• 金额: $ 71.94万
• 依托单位: Purdue Research Foundation
• 依托单位国家: 美国
• 项目类别: Continuing Grant
• 财政年份: 1991
• 资助国家: 美国
• 起止时间: 1991-09-15 至 1997-10-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://www.nsf.gov/awardsearch/showAward?AWD_ID=9102855&HistoricalAwards=false
• 关键词: ray; Determination; Protein; Viruses

The structure, function and evolutionary relationship of various RNA and DNA plant and animal viruses are to be studied by use of X-ray diffraction methods. Recently, Dr. Rossmann solved the first structure of a single-stranded DNA virus (canine parvovirus). He now wishes to exploit this structure to investigate such functions as, for instance, the canyon-like depression on its surface (is it the site of receptor attachment?), the spikes on the threefold axes (is this the site where neutralizing antibodies attach?), the fivefold cylindrical structure (is this required for transport of the virus to the cell nucleus) or the structure of part of the ssDNA bound to the capsid proteins (does the viral coat protein recognize a specific DNA sequence?) Dr. Rossmann is also studying the ssDNA bacterial virus X174 and other structure such as those of the cauliflower mosaic virus two dsRNA viruses (reo- and rotaviruses) and the core of Sindbis virus. The primary techniques will depend on fast X-ray diffraction data collection at the Cornell High Energy Synchrotron Source, data processing on Purdue's Cyber 205 supercomputer, phasing primarily by use of the noncrystallographic symmetry and model building and analysis on interactive compute graphics systems.

各种植物的结构、功能和进化关系 RNA和DNA植物和动物病毒将通过使用 X射线衍射法。 最近，罗斯曼博士解决了第一个 单链DNA病毒（犬细小病毒）的结构。 他 现在希望利用这种结构来研究这些功能 例如，它表面上的峡谷状凹陷（是吗？ 受体附着的部位？），三重轴上的尖刺 (is这是中和抗体附着的部位？），的 五重圆柱形结构（这是运输所需的 病毒的细胞核）或部分的结构， ssDNA与衣壳蛋白结合（病毒外壳蛋白 识别特定的DNA序列？） Rossmann博士还在研究ssDNA细菌病毒X174， 其他结构如花椰菜花叶病毒2的结构 dsRNA病毒（呼肠孤病毒和轮状病毒）和辛德毕斯病毒的核心。 主要的技术将取决于快速X射线衍射数据 在康奈尔高能同步加速器源收集， 在普渡大学的赛博205超级计算机上进行数据处理， 主要是利用非晶体学对称性和模型 交互式计算机图形系统的建立与分析。