Transcription of a U6 Small Nuclear RNA Gene

U6 小核 RNA 基因的转录

基本信息

  • 批准号:
    9808214
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 9万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
    Continuing Grant
  • 财政年份:
    1998
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    1998-09-01 至 2002-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

9808214 Kunkel Experiments in this project are designed to explore the mechanism of activation of human small nuclear RNA (snRNA) gene promoters in cultured human cells. The primary focus of this work is on the human U6 gene (although other snRNA genes will be investigated in one project). The transcription of vertebrate U6 genes is carried out by RNA polymerase III, but the promoter is constructed of a number of DNA control elements used in pol II genes. Furthermore, the U6 transcription complex is composed, in part, of factors that are shared between pol II and pol III promoters. For example, the distal region of the human U6 gene, located greater than 150 bp upstream of the transcriptional start site, contains a consensus octamer motif found in the same location as in the pol II-transcribed snRNA genes (e.g., U1 and U2 genes), and this element is bound by purified Oct-1 factor. In addition, a SPH motif that is common to many vertebrate snRNA gene enhancers is adjacent to the octamer motif in the human U6 distal promoter. The objectives of this project are: (1) the molecular characterization of human SPH-binding factor (hSBF/ZNF143), which interacts with the human U6 distal region. Using a cDNA clone encoding this transcription factor, will be investigated regions of the protein that are responsible for transcriptional stimulation and nuclear localization using transient transfection and in vitro transcription assays. (2) A comparison of the transcriptional activation by hSBF/ZNF143 of the pol III-transcribed U6 promoter and the pol II-transcribed human U2 promoter, using similar techniques. (3) The identification of protein(s) in the U6 transcription complex that interact with distal region binding factors, hSBF/ZNF143 and Oct-1. Protein-protein binding will be investigated by immunoselection using antisera specific for each protein, and the use of chemical and photoactivatable cross-linking agents. Small nuclear (snRNAs) are key components in fundamental pathways of gen e expression in eukaryotic cells. Furthermore, snRNA genes are among the most active ones in rapidly growing cells. Results from experiments in this project will provide important information regarding the mechanism of transcription of highly expressed genes. One or more objectives of this research will serve as the basis for the training of at least one graduate student and of 3-10 undergraduate students in the research laboratory.
小行星9808214 本项目旨在探索人小核RNA(small nuclear RNA,snRNA)基因启动子在培养的人细胞中的激活机制。 这项工作的主要重点是人类U6基因(尽管其他snRNA基因将在一个项目中进行研究)。 脊椎动物U6基因的转录由RNA聚合酶III进行,但启动子由pol II基因中使用的许多DNA控制元件构成。 此外,U6转录复合物部分由pol II和pol III启动子之间共享的因子组成。 例如,位于转录起始位点上游大于150 bp的人U6基因的远端区含有在与pol II转录的snRNA基因相同的位置发现的共有八聚体基序(例如,U1和U2基因),并且该元件被纯化的Oct-1因子结合。 此外,SPH基序是常见的许多脊椎动物的snRNA基因增强子是相邻的八聚体基序在人类U6远端启动子。 本课题的主要目的是:(1)研究人SPH结合因子(hSBF/ZNF 143)的分子生物学特性。 使用编码该转录因子的cDNA克隆,将使用瞬时转染和体外转录测定研究负责转录刺激和核定位的蛋白质区域。 (2)使用类似的技术比较hSBF/ZNF 143对pol III转录的U6启动子和pol II转录的人U2启动子的转录激活。 (3)U6转录复合物中与远端区结合因子hSBF/ZNF 143和Oct-1相互作用的蛋白的鉴定。 蛋白质-蛋白质结合将通过使用对每种蛋白质具有特异性的抗血清的免疫选择以及使用化学和光活化交联剂来研究。 小核RNA(snRNAs)是真核细胞基因表达的重要组成部分. 此外,snRNA基因是快速生长细胞中最活跃的基因之一。 本项目的实验结果将为高表达基因的转录机制提供重要信息。 本研究的一个或多个目标将作为在研究实验室培训至少一名研究生和3-10名本科生的基础。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Gary Kunkel其他文献

Gary Kunkel的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Gary Kunkel', 18)}}的其他基金

REU Site: Summer Undergraduate Research Program in Biochemistry
REU 网站:生物化学夏季本科生研究计划
  • 批准号:
    1358941
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
REU Site: Summer Undergraduate Research Program in Biochemistry
REU 网站:生物化学夏季本科生研究计划
  • 批准号:
    0851611
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
REU Site: Summer Undergraduate Research Program in Biochemistry
REU 网站:生物化学夏季本科生研究计划
  • 批准号:
    0552822
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
REU Site - Summer Undergraduate Research Program in Biochemistry
REU 网站 - 生物化学夏季本科生研究计划
  • 批准号:
    0139246
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Transcription of a U6 Small Nuclear RNA Gene
U6 小核 RNA 基因的转录
  • 批准号:
    9304799
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Transcription of U6 Small Nuclear RNA
U6 小核 RNA 的转录
  • 批准号:
    8903970
  • 财政年份:
    1989
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Continuing Grant

相似国自然基金

红螯螯虾高活性U6启动子的鉴定及其 CRISPR/Cas9基因编辑系统的构建与应用
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    10.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
鱼类U6启动子的转录调控机制和应用研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    15.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
基于葡萄U3/U6启动子的CRISPR/Cas9多基因编辑体系构建及其在糖、酸和抗寒等性状改良中的应用
  • 批准号:
    32001994
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    24.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
UPIb/U6嵌合型启动子靶向调控胸腺素β4表达对膀胱癌上皮-间质转化的作用机制
  • 批准号:
    30872561
  • 批准年份:
    2008
  • 资助金额:
    31.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
肿瘤特异靶向性hTERT/U6嵌合启动子的shRNA表达载体构建及钠米硅介导的转染探讨
  • 批准号:
    30400539
  • 批准年份:
    2004
  • 资助金额:
    21.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
指导U6 snRNA甲基化的snoRNA新基因研究
  • 批准号:
    30170216
  • 批准年份:
    2001
  • 资助金额:
    18.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

The molecular mechanism of U6 snRNA activation for pre-mRNA splicing
U6 snRNA激活前mRNA剪接的分子机制
  • 批准号:
    298521-2011
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
The molecular mechanism of U6 snRNA activation for pre-mRNA splicing
U6 snRNA激活前mRNA剪接的分子机制
  • 批准号:
    298521-2011
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
The molecular mechanism of U6 snRNA activation for pre-mRNA splicing
U6 snRNA激活前mRNA剪接的分子机制
  • 批准号:
    298521-2011
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
The molecular mechanism of U6 snRNA activation for pre-mRNA splicing
U6 snRNA激活前mRNA剪接的分子机制
  • 批准号:
    298521-2011
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
Mechanisms of RNA polymerase-specific transcription complex assembly on U1 and U6 snRNA gene promoters
U1和U6 snRNA基因启动子上RNA聚合酶特异性转录复合物组装的机制
  • 批准号:
    1157549
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
The molecular mechanism of U6 snRNA activation for pre-mRNA splicing
U6 snRNA激活前mRNA剪接的分子机制
  • 批准号:
    298521-2011
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
U6 RNA - U2 COMPLEX
U6 RNA - U2 复合物
  • 批准号:
    8361219
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
U6 RNA - PRP24 COMPLEX
U6 RNA - PRP24 复合物
  • 批准号:
    8361195
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
STRUCTURE OF THE U2-U6 COMPLEX
U2-U6 复合体的结构
  • 批准号:
    8361193
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
NMR OF U6 RNA
U6 RNA 的 NMR
  • 批准号:
    8361218
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 9万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了