Genetic Recombination in Brome Mosaic Virus: The Role of Intergenic Region in Junction Site Selection

雀麦花叶病毒的基因重组:基因间区域在连接位点选择中的作用

基本信息

  • 批准号:
    9983033
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 33万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
    Continuing Grant
  • 财政年份:
    2000
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2000-02-15 至 2004-01-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

ABSTRACTThe long-term goal of this project is to understand the mechanism(s) of genetic recombination in RNA viruses. By using brome mosaic bromovirus (BMV) as a model RNA virus, mechanistic differences between homologous and nonhomologous events at the RNA and protein levels have been previously reported. These studies have suggested a copy choice mechanism, where the BMV replicase complex has changed among the RNA templates during RNA replication. To define the role of signal sequences during the junction sites selection and thus to determine the conditions leading to the efficient recombination hot spots, this project focuses on the multifunctional intergenic region in BMV RNA3. Frequent homologous exchanges between molecules of BMV RNA3 within the intergenic hot spot have been recently confirmed experimentally. One goal of this project is to map the recombinationally active sequences inside the intergenic region, by using molecular genetics approaches. Its second goal is to determine how these sequences relate to each other in order to direct the junction sites efficiently. Specific aims to achieve the above research goals include studies of the role of a subgenomic promoter in recombination, including 1) the core region; 2) the polyA tract; 3) enhancing sequences; and 4) secondary structures. This novel experimental approach will help us obtain new data regarding the mechanism(s) of homologous RNA recombination. This, in turn, will provide information concerning the control of recombination activities in RNA viruses. The results of this model research will be applicable to a variety of RNA viruses that utilize intergenic (subgenomic) promoter sequences.
本项目的长期目标是了解核糖核酸病毒中基因重组的机制(S)。通过使用雀麦花叶溴病毒(BMV)作为模式RNA病毒,已有报道在RNA和蛋白质水平上同源和非同源事件之间的机制差异。这些研究提出了一种复制选择机制,即BMV复制酶复合体在RNA复制过程中在RNA模板中发生变化。为了确定信号序列在连接位点选择中的作用,从而确定导致有效重组热点的条件,本项目专注于BMV RNA3中的多功能基因间隔区。近年来,BMV RNA3分子间频繁的同源交换已被实验证实。这个项目的一个目标是通过分子遗传学的方法定位基因间隔区内的重组活性序列。它的第二个目标是确定这些序列是如何相互关联的,以便有效地指导连接位点。实现上述研究目标的具体目标包括研究亚基因组启动子在重组中的作用,包括1)核心区;2)Polya区;3)增强序列;4)二级结构。这一新的实验方法将帮助我们获得关于同源核糖核酸重组机制(S)的新数据。这反过来将提供有关RNA病毒中重组活动控制的信息。该模型研究的结果将适用于利用基因间(亚基因组)启动子序列的各种RNA病毒。

项目成果

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  • 资助金额:
    $ 33万
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  • 资助金额:
    $ 33万
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