Investigation of a novel segmented flow approach for magnetic-bead-based processing of biochemical assays and its application for continuous single-cell DNA extraction

研究基于磁珠的生化分析处理的新型分段流方法及其在连续单细胞 DNA 提取中的应用

基本信息

项目摘要

Wir entwickeln eine auf „segmentiertem Fluss“ basierende, mikrofluidische Plattform zur kontinuierlichen biomolekularen Untersuchungen einzelner Zellen. Die Zellen werden in Tröpfchen eingeschlossen, die durch eine nicht-mischbare kontinuierliche Phase voneinander getrennt sind. Das Projekt erweitert den Stand der Technik in der Tröpfchen-basierten Mikrofluidik deutlich durch:(1) Implementierung des kompletten Prozesses von der Zell-Lyse, über die Extraktion von Biomolekülen (z. B. DNA), bis zur anschließenden Aufreinigung, Vervielfältigung und Detektion.(2) Verwendung funktionalisierter magnetischer Partikel nicht nur zur Festphasenextraktion, sondernauch zur Steuerung der Tröpfchen und dem sequentiellen Transfer der Biomoleküle zwischen denunterschiedlichen Flüssigkeits-Kompartimenten bei minimaler Probenverschleppung.(3) Flexible Zeitsteuerung der Tröpfchenbewegungen mittels externer magnetischer Felder ohne aufwendige und kostspielige elektrische Konkate auf dem Chip.Die Ergebnisse dieser Forschung vergrößern die Anzahl der Assays, welche mittels „segmentierter Fluss“ Mikrofluidik implementiert werden können. Konkrete Beispiele sind; (i) kontinuierliche ProzessÜberwachungen wie die Online-Überwachung von Fermentationsprozessen, und (ii) Einzel- Zelluntersuchungen ausgehend von geringen Proben-Mengen z. B. aus Biopsie bei Krebsoperation.
我们将建立一个基于“分段Fluss”的微流控平台,以持续研究一个Zelner Zellen。海伦韦尔登在特洛普夫琴的一个小插曲中,通过一个不太复杂的连续阶段,她被吸引了。本课题通过以下几个方面提高了德国微流控技术的水平:(1)Zell-Lyse复合工艺的实施,即生物分子萃取(z. B。DNA),bis zur anschließenden Aufreinigung,Vervielfältigung und Detektion. (2)Verwendung funktionalisierter magnetischer Partikel nicht努尔zur Festphasenextracktion,sondernauch zur Steuerung der Tröpfchen und dem sequentiellen Transfer der Biomoleküle zwischen denunteriedlichen Flüssigkeits-Kompartimenten bei minimaler Probenverschleppung. (3)Flexible Zeitsteuerung der Tröpfchenbewegungen mittels externer magnetischer Felder ohne aufwendige und kostspielige elektrische Konkate auf dem Chip.Die Ergebnisse dieser Forschung vergrößern die Anzahl der Assays,welche mittels“segmentierter Fluss”Mikrofluidik implementert韦尔登können. Konkrete Beispiele sind;(i)在线发酵过程的连续性过程,和(ii)在线发酵过程的连续性过程。B。活检和手术。

项目成果

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