Relationale Wachstumsgrammatiken als Basis für ein mehrskaliges metabolisches Strukturmodell der Gerste: Neue Techniken der Informatik für Functional-Structural Plant Modells (FSPM)
关系增长语法作为大麦多尺度代谢结构模型的基础:功能结构植物模型(FSPM)的新计算机科学技术
基本信息
- 批准号:14436047
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Grants
- 财政年份:2005
- 资助国家:德国
- 起止时间:2004-12-31 至 2007-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Im Rahmen eines ausgelaufenen DFG-Projekts wurde die formale Modell-spezifikations-Methode der Relationalen Wachstumsgrammatiken (Relational Growth Grammars, RGG) entwickelt, mit der interaktiven Software GroIMP (Growth Grammar Related Interactive Modelling Platform) operabel gemacht und an ersten Beispielen demonstriert. Da Formalismus und Software zunächst schrittweise ausgebaut und getestet werden mussten, waren diese Beispiele bisher auf sehr ausschnitthafte Modelle beschränkt. Um die Verwendbarkeit der RGG für biologisch relevante Struktur-Funktions-Modelle von Pflanzen unter Beweis zu stellen, ist ihr Einsatz für ein komplexeres, mehrskaliges Modell erforderlich: Aus der ehemaligen Forschergruppe ¿Virtual Crops¿ liegen am Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK) erhobene Daten zum Stickstoffmetabolismus der Gerste in seinem Zusammenspiel mit Wachstum und Architekturentwicklung (ober- und unterirdisch) vor, welche für die Parametrisierung und Validierung eines solchen Modells genutzt werden sollen. Dieses Modell soll in enger Zusammenarbeit mit den 3 Abteilungen Molekulare Zellbiologie (Dr. H.-P. Mock) sowie dem Genomzentrum des IPK (Dr. Patrick Schweizer) erstellt werden, wobei besonderes Augenmerk der Nutzerfreundlichkeit und dem Einsatz des Modells als Hilfsmittel zur Wissensorganisation und für Hypothesentests gilt. ¿ Als Bestandteil eines solchen mehrskaligen Modells mit genetischen, metabolischen und Architektur-Komponenten soll das Gerstenmeristem mit dreidimensional modellierten Gewebetypen (Zell-verbänden) spezifiziert und dynamisch modelliert werden; hierzu ist der RGG-Formalismus noch zu erweitern.
Im Rahman eines auglaufenen DFG-Projekts Wurde die Formale Model-Speifikations-Methode der Relationalen WachstumsGramticken(Relational Growth Grammars,RGG)entwickelt,MIT der Interaktiven Software GroIMP(Growth Grammar Related Interactive ModelingPlatform)Operabel Gemacht and an ersten Beispielen demstriert.Da Formarismus and Software zunächst schrittweise auggebaut wt den mussten,waren diese beispiele Bisher auf sehr aus schschnitthafte Modelle Beschränkt.与RGG für生物学相关的结构和功能--Modelle von Pflanzen Unter Beweis zu stellen,it ihr einatz für ein komplexes,mehrskaces modell erforderlich:Aus der ehemaligen en Forschergruppe and Virtual庄稼?liegen am InInstitute t für Pflanzengenetik and Kulturpflanzenforschung(IPK)erhobene Datenstoffmus der Gerste in Zusmenamel Mit Machstel and Architturententen(Ober-und unterirdisch)or mehhrskate es devell er erfortrentlich:auus der ehemaligen Forschergruppe and Kulturpflanzenforschung(IPK)Erhobene Daten Datum Stickstoffmus der Gerste der Gerste in ZusmenamSpiel Machstel Mun Archekturwentum(Ober-und unterdisch)or mehrskaces:Aus der ehemagen en Forschergruppe de vleegen am InInstitute t für Pflanzengenetik and Kulturpflanzenforschenforgung(IPK)。Deses modell soll in Enger Zusammenarbeit MIT den 3 Abteilungen Molekulare Zellbiologie(Dr.H.-P.Mock)Sowie DEM Genomzentrum des IPK(Dr.Patrick Schweizer)erstellt Weden,wobebebebeesmerderes Augenmerk der Nutzerfreundlichkeit and DEM einatz des Modelells ALS Hilfsmittel zur WisensOrganization und für Hypotheentest gilts。[Als Bestandteil eines solchen mehrskaligen modells MIT Genetischen,comvedischen and Architekur-Komponenten soll das Gertenmeristem MIT三维模型(Zell-verbänden)Spezifiziert and Dynamisch Modelert Ware den;Hizu ist der RGG-ForMalismus noch zu erwetern]。
项目成果
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