Modelling frictional forces in protein dynamics (A07)

蛋白质动力学中的摩擦力建模 (A07)

• 批准号: 162960888
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Theoretische Physik
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Collaborative Research Centres
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2009-12-31 至 2011-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/162960888?language=en
• 关键词: Modelling; frictional; forces; protein; dynamics

Aufgrund der Hydrierung und des hohen Grads der Verschlaufung der Polypeptidketten während Proteinfaltungs-, -assemblierungs- oder auch Transportvorgängen, dominieren Reibungskräfte die Response von Proteinen auf externe Störungen. Das Ziel dieses Projekts ist ein theoretisches Studium von intra-Ketten-Reibung sowie Lösungsmittel-induzierter Reibung in Proteinen, um ein detailliertes, mikroskopisches Verständnis biomolekularer Mechanik zu erreichen. In enger Zusammenarbeit mit den Experimenten aus den Projekten A2, A6 und A8 werden wir die dynamische und kinetische Response von Proteinfragmenten untersuchen. Dabei werden atomistische und coarse-grained Computersimulationen zum Einsatz kommen, die schlussendlich zu einer reduzierten Fokker-Planck-Beschreibung der Diffusion in einer schematischen, rauen Energielandschaft führen werden.

在水化和高梯度的多肽反应过程中，蛋白质的反应-，-酶解-或运输-主要是蛋白质在体外的反应。这两个项目是一个关于蛋白质中Lösungsmittel-induzierter Reibung的内部Ketten-Reibung理论研究，一个详细的研究，微生物学研究是生物分子力学的一个方面。通过对A2、A6和A8韦尔登的实验研究，我们得到了发动机的动力学和运动学响应。大韦尔登原子和粗粒度的计算机模拟，在一个示意图中简化Fokker-Planck-Beschreibung的扩散，以获得韦尔登的能量。