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Some Algorithmic Issues in Computational Biology

Some Algorithmic Issues in Computational Biology
计算生物学中的一些算法问题
批准号：
0311321
负责人：
S. Rao Kosaraju
金额：
$8.07万
依托单位：
Johns Hopkins University
依托单位国家：
美国
项目类别：
Standard Grant
财政年份：
2003
资助国家：
美国
项目状态：
已结题
起止时间：
2003-08-15 至 2005-07-31
来源：
https://www.nsf.gov/awardsearch/showAward?AWD_ID=0311321&HistoricalAwards=false
关键词：
SomeAlgorithmicIssuesComputationalBiology

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
涉及计算生物学中几个问题的算法问题将被研究。强调基因网络、DNA序列组装和DNA序列分析的问题。基因网络试图解释由于基因组中基因的两两缺失而观察到的细胞致命性。在DNA序列组装领域，我们提出了算法的发展，以更好地利用配偶对数据。在DNA序列分析中提出的问题涉及空间高效动态数据结构的构建，以执行快速的近似匹配查询。
英文摘要
Algorithmic issues concerning several problems in Computational Biologywill be investigated. Problems on Gene Networks, DNA SequenceAssembly and DNA Sequence Analysis will be emphasized. A Gene Network triesto explain the observed lethality of a cell due to pairwise deletion of genesin its genome. In the DNA Sequence Assembly area, we propose development ofalgorithms for a better utilization of mate pairs data. The proposedproblems in the DNA Sequence Analysis deal with the construction ofspace efficient dynamic data structures for performing fast approximatematch queries.
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Understanding the Immune System Responses
  • 批准号：
    0650141
  • 项目类别：
    Standard Grant
  • 资助金额：
    $0.0万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    S. Rao Kosaraju
  • 依托单位：
    Johns Hopkins University
Topics in Algorithm Design
  • 批准号：
    9821058
  • 项目类别：
    Standard Grant
  • 资助金额：
    $25.22万
  • 财政年份：
    1999
  • 负责人：
    S. Rao Kosaraju
  • 依托单位：
    Johns Hopkins University
Topics in Algorithm Design
  • 批准号：
    9508545
  • 项目类别：
    Continuing Grant
  • 资助金额：
    $28.75万
  • 财政年份：
    1995
  • 负责人：
    S. Rao Kosaraju
  • 依托单位：
    Johns Hopkins University
Topics in Computing
  • 批准号：
    9107293
  • 项目类别：
    Continuing Grant
  • 资助金额：
    $28.58万
  • 财政年份：
    1991
  • 负责人：
    S. Rao Kosaraju
  • 依托单位：
    Johns Hopkins University
海外基金