课题基金 / 基金详情

III-CTX: Large-Scale Analysis of Collections of Phylogenetic Trees

III-CTX: Large-Scale Analysis of Collections of Phylogenetic Trees
III-CTX:系统发育树集合的大规模分析
批准号:
0713618
负责人:
Tiffani Williams
金额:
$0.0万
依托单位国家:
美国
项目类别:
Continuing Grant
财政年份:
2007
资助国家:
美国
项目状态:
已结题
起止时间:
2007-08-15 至 2011-07-31

项目摘要

项目成果

Tiffani Williams的其他基金

相似基金

相关文献

中文摘要
翻译
给定一组生物(或分类群),系统发育分析的目标是生成一棵描述分类群之间谱系关系的进化树。推断出一棵代表对事实的良好假设的系统发育树是一个难题。系统发育启发式试图在指数大小的树空间中搜索非常小的一部分,以寻找真正进化树的良好近似值。拟议研究项目的总体目标是开发信息丰富的方法,用于分析在系统发育搜索过程中遇到的大量树木。更好地理解搜索行为可以推动更好的启发式设计,最终导致更准确的系统发育树重建。具体的研究目标包括:(i)开发一个搜索历史存储库,其中包含通过系统发育启发式检查的所有树;(ii)设计用于利用搜索历史存储库中的信息模式的算法;(iii)开发可视化工具,提供驻留在存储库中的数据的信息视图。为这个研究项目开发的新的数据分析和可视化技术将补充现有的nsf资助的建立系统发生学的努力,如“生命之树”,所有已知生物的进化史。此外,拟议的工作将为不同的学生群体提供指导和跨学科培训。
英文摘要
Given a collection of organisms (or taxa), the objective of a phylogenetic analysis is to produce an evolutionary tree describing the genealogical relationships between the taxa. Inferring a phylogenetic tree that represents a good hypothesis of the truth is a difficult problem. Phylogenetic heuristics attempt to search a very small fraction of the exponentially-sized tree space for good approximations of the true evolutionary tree. The overall goal of the proposed research project is to develop information-rich methods for analyzing the large collection of trees encountered during a phylogenetic search. A better understanding of search behavior can drive the design of better heuristics, which ultimately lead to more accurate reconstructions of phylogenetic trees. Specific research objectives include: (i) developing a search history repository that contains all of the trees examined by a phylogenetic heuristic; (ii) designing algorithms for exploiting informative patterns in a search history repository; and (iii) developing visualization tools that provide informative views of the data residing in the repository. The novel data analysis and visualization techniques developed for this research project will complement existing NSF-funded efforts to build phylogenies such as "The Tree of Life", the evolutionary history of all known organisms. Moreover, the proposed work will provide mentoring and interdisciplinary training to a diverse group of students.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Collaborative Research: A Data-Driven Employer-Academia Partnership for Continual Computing Curricular Change
Collaborative research: Automated and community-driven synthesis of the tree of life
III: Small: Collaborative: Novel Techniques for Understanding Convergence in Large-Scale Markov Chain Monte Carlo Phylogenetic Analyses
国内基金
海外基金
硒掺杂V2CTx的全MXene基柔性水系锌离子混合电容器的性能提升机制研究
  • 批准号:
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
  • 依托单位:
基于Mo2CTx可见光表面等离激元的热载流子动力学定量研究
  • 批准号:
    12304047
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    30万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    见超超
  • 依托单位:
V2CTx MXene载流子传输层改性及应用于紫外光电探测器研究
  • 批准号:
    52362018
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    32.00万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    罗光灿
  • 依托单位:
CTX通过M2型巨细胞重塑成纤维细胞亚群介导卵巢功能损伤的机制研究
  • 批准号:
    82301834
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    30万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    廖秋月
  • 依托单位: