The Network Interface between Gene Regulation and Metabolism - Mathematical Description, Dynamics, and Evolutionary Design Principles

In diesem Projekt werden wir ein Materialflussnetz (Metabolismus) und ein Boolesches Regulationsnetz (Genregulation) zusammenfgen und die dynamischen Prozesse dieser beiden verkoppelten Netzwerke analysieren。利用数学模型模型，对系统动力学和系统动力学之间的相同动力学进行了分析，并对系统动力学进行了分析。Das verkoppelte System wind auf dreskalen diskutiert:(1) abstrakte Boolesche Netze, die mit abstrakten Flussnetzen verkoppelt sind, (2) spezifische Modelle wohldefiniterzellulärer Prozesse (die wir in entsprechende regulatorische and metabolische Unternetzwerke zerlegen), (3) verkoppelte Netzwerke der Genregulation and metabolischer Reaktionen auder Skala ganzer Organismen （E. coli, Hefe, Mensch）。insbesonere wollen wir versteen，我们说的是as Zusammenspiel der been Systeme evolutionär entwickelt，我们说的是System andere auf iner evolutionären Zeitskala geprägt。(2)数学模型<s:1>动力学模型<e:1>与遗传调节与代谢模型(3)动力学模型<e:1>与遗传调节与代谢模型(3)动力学模型<s:1>与遗传调节与代谢模型(3)动力学模型<s:1>与遗传调节与代谢模型(3)动力学模型与遗传调节与代谢模型(3)动力学模型与遗传调节与代谢模型(3)动力学模型与遗传调节与代谢模型(3)动力学模型与遗传调节与代谢模型(4)动力学模型与遗传调节与代谢模型(3)动力学模型与遗传调节与代谢模型(4)动力学模型与遗传调节与代谢模型(4)动力学模型与遗传调节与代谢模型(4)动力学模型与遗传调节与代谢模型(4)动力学模型与遗传调节与代谢模型(4)

In diesem Projekt werden wir ein Materialflussnetz (Metabolismus) und ein Boolesches Regulationsnetz (Genregulation) zusammenfügen und die dynamischen Prozesse dieser beiden verkoppelten Netzwerke analysieren. Wir werden mathematische Modelle verwenden, um die gemeinsame Dynamik der beiden Systeme zu beschreiben und so zu einer integrierten Sicht auf das System zu gelangen. Das verkoppelte System wird auf drei Skalen diskutiert: (1) abstrakte Boolesche Netze, die mit abstrakten Flussnetzen verkoppelt sind, (2) spezifische Modelle wohldefinierter zellulärer Prozesse (die wir in entsprechende regulatorische und metabolische Unternetzwerke zerlegen, (3) verkoppelte Netzwerke der Genregulation und metabolischer Reaktionen auf der Skala ganzer Organismen (E. coli, Hefe, Mensch).Insbesondere wollen wir verstehen, wie sich das Zusammenspiel der beiden Systeme evolutionär entwickelt hat und wie jedes System das andere auf einer evolutionären Zeitskala geprägt hat.Folgende Resultate streben wir an: (1) ein Formalismus zur Analyse und Beschreibung verkoppelter Fluss- und Regulationsnetzwerke, (2) mathematische Modelle für die Dynamik ausgewählter Subsysteme an der Schnittstelle von Genregulation und Metabolismus und (3) einen konzeptionellen Ansatz für Schnittstellenkrankheiten, als eine dynamische Sichtweise auf das systemweite Fehlschlagen auf beiden Ebenen zellulärer Organisation.