Structural characterization of rod phosphodiesterase 6 using mass spectrometry

使用质谱法表征杆状磷酸二酯酶 6 的结构

基本信息

  • 批准号:
    1307367
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 40万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
    Standard Grant
  • 财政年份:
    2013
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2013-08-01 至 2017-07-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

With this award, the Chemistry of Life Processes Program is supporting the collaborative research of Drs. Feixia Chu and Rick Cote at University of New Hampshire on the structural characterization of a central phototransduction effector enzyme, photoreceptor phosphodiesterase-6 (PDE6). PDE6 modulates cGMP levels in the photoreceptor outer segment to define the amplitude, duration and adaptation of the photoresponse in vertebrate photoreceptors. This study aims to elucidate the structural determinants of PDE6 allosteric regulators, the spatial organization and molecular recognition of the dynamic PDE6 signaling complex. This research is interdisciplinary, involving the combination of mass spectometry and protein biochemistry to study the underlying structural elements that govern the PDE6 activation/deactivation cycle.This work is expected to both shed light on key events in the visual cycle and the molecular level, focusing on a key protein involved in signal transduction. In a more general sense, the work is expected to lead to strategies and methods to detect protein conformational change, especially in structurally heterogeneous systems, with potentially applicability to technically challenging membrane proteins and protein complexes. The interdisciplinary nature of this project will expose undergraduate and graduate students and a postdoctoral trainee to a broad set of skills at the interface of biochemistry, mass spectrometry-based proteomics and structural analysis. In addition to the proposed research, the research team personnel will continue to participate in education and outreach efforts at the Chemistry/Biology interface at the University of New Hampshire.
有了这个奖项,生命过程的化学计划是支持博士的合作研究。美国新罕布什尔大学的Chu Feixia和Rick Cote研究了一种中心光导效应酶——光受体磷酸二酯酶-6 (PDE6)的结构特征。PDE6调节光感受器外段的cGMP水平,决定脊椎动物光感受器光反应的幅度、持续时间和适应性。本研究旨在阐明PDE6变构调节因子的结构决定因素、动态PDE6信号复合物的空间组织和分子识别。本研究是跨学科的,涉及质谱和蛋白质生物化学的结合,以研究控制PDE6激活/失活周期的潜在结构要素。这项工作有望揭示视觉周期和分子水平的关键事件,重点关注参与信号转导的关键蛋白质。从更广泛的意义上说,这项工作有望导致检测蛋白质构象变化的策略和方法,特别是在结构异质系统中,具有潜在的适用性,技术上具有挑战性的膜蛋白和蛋白质复合物。该项目的跨学科性质将使本科生、研究生和博士后实习生在生物化学、基于质谱的蛋白质组学和结构分析的界面上获得广泛的技能。除了拟议的研究之外,研究团队人员将继续参与新罕布什尔大学化学/生物界面的教育和推广工作。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Feixia Chu其他文献

An apicomplexan bromodomain protein, TgBDP1, associates with diverse epigenetic factors to regulate essential transcriptional processes in emToxoplasma gondii/em
一种顶复门寄生虫溴结构域蛋白 TgBDP1 与多种表观遗传因子相关联,以调节弓形虫中重要的转录过程
  • DOI:
    10.1128/mbio.03573-22
  • 发表时间:
    2023-06-13
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.700
  • 作者:
    Krista Fleck;Seth McNutt;Feixia Chu;Victoria Jeffers;John C. Boothroyd
  • 通讯作者:
    John C. Boothroyd
Identification of tyrosine sulfation in Conus pennaceus conotoxins α‐PnIA and α‐PnIB: further investigation of labile sulfo‐ and phosphopeptides by electrospray, matrix‐assisted laser desorption/ionization (MALDI) and atmospheric pressure MALDI mass spectrometry
南美芋螺毒素 α-PnIA 和 α-PnIB 中酪氨酸硫酸化的鉴定:通过电喷雾、基质辅助激光解吸/电离 (MALDI) 和大气压 MALDI 质谱进一步研究不稳定的磺基和磷酸肽
  • DOI:
  • 发表时间:
    1999
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    J. Wolfender;Feixia Chu;Haydn L. Ball;F. Wolfender;M. Fainzilber;Michael A. Baldwin;Alma L. Burlingame
  • 通讯作者:
    Alma L. Burlingame

Feixia Chu的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Feixia Chu', 18)}}的其他基金

Equipment: MRI: Track #1 Acquisition of an Orbitrap Eclipse Tribrid Mass Spectrometer
设备: MRI:轨道
  • 批准号:
    2320241
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
    Standard Grant

相似海外基金

Generation and Characterization of Novel Large Animal Models of Usher Syndrome Type 3
3 型亚瑟综合症新型大型动物模型的生成和表征
  • 批准号:
    10706969
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
Generation and Characterization of Novel Large Animal Models of Usher Syndrome Type 3
3 型亚瑟综合症新型大型动物模型的生成和表征
  • 批准号:
    10372342
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
Characterization of a Filopodial Myosin
丝状肌球蛋白的表征
  • 批准号:
    10403958
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
Isolation, Characterization and Reconstruction of Vertebrate Striated Muscle Myosin Filaments
脊椎动物横纹肌肌球蛋白丝的分离、表征和重建
  • 批准号:
    10043292
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
Isolation, Characterization and Reconstruction of Vertebrate Striated Muscle Myosin Filaments
脊椎动物横纹肌肌球蛋白丝的分离、表征和重建
  • 批准号:
    10268975
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
Development and characterization of mouse models of RP59 DHDDS deficiency
RP59 DHDDS 缺陷小鼠模型的开发和表征
  • 批准号:
    10200065
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
Identification and characterization of factors affecting cytoskeletal proteins--the mediators of bacterial cell shape
影响细胞骨架蛋白的因素的鉴定和表征——细菌细胞形状的介质
  • 批准号:
    9905535
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
Molecular Genetic Characterization of Alstrom Syndrome
阿尔斯特罗姆综合征的分子遗传学特征
  • 批准号:
    8066254
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
Nanoscale Biomembrane Characterization: Model Systems to Cells
纳米级生物膜表征:细胞模型系统
  • 批准号:
    7810125
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
Molecular Genetic Characterization of Alstrom Syndrome
阿尔斯特罗姆综合征的分子遗传学特征
  • 批准号:
    7768422
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 40万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了