REU Site: Educating for the grand challenges at the intersection of biocomplexity and high-performance computing

REU 网站:针对生物复杂性和高性能计算交叉领域的重大挑战进行教育

基本信息

  • 批准号:
    1358997
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 31.64万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
    Standard Grant
  • 财政年份:
    2014
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2014-04-01 至 2017-07-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

This REU Site award to the University of Missouri (MU), located in Columbia, MO, will support the training of 12 students for 9 weeks during the summers of 2014-2016. This award is supported by both the Directorates for Biological Sciences (Division of Biological Infrastructure) and Mathematical and Physical Sciences (Division of Mathematical Sciences). Pairs of student researchers, one from the computational sciences and the other from the life sciences, will work collaboratively at the interface of high performance computing and big data biology. Students will select from a diverse group of research projects, with a choice of mentors from five departments in the computational and life sciences. Example projects include developing parallel computing approaches to allow the identification of gene duplications that occurred with important evolutionary transitions such as the origins of mammalian placentation and using parallel computers and GPUs to infer the plant tree of life with data from high-throughput sequencing. In addition, participants will join other campus summer research programs -- attending professional development sessions, training in the responsible conduct of research, and participating in weekly sessions on parallel computing and biology. Participants will be recruited from a variety of institutions, with preference given to students from minority-serving institutions and undergraduate-only colleges. The PIs and research mentors will select the participants (half from the computational and half from the life sciences) and help them choose a computational or biological partner. Participants' progress will be assessed with pre- and post-tests covering the program's technical material. The program will be evaluated using NSF's common assessment tool.Computation, and especially parallel computation, will be vital to science and engineering in the future, as increasing data volumes from instruments such as next-generation DNA sequencers generate enormous amount of data. The training and research experience offered at this REU site will give the participants unique opportunities to be trained in this important area.Students are required to be tracked after the program and must respond to an automatic email sent via the NSF reporting system. More information is available by visiting http://muii.missouri.edu/reu_bigdata, or by contacting the PI (Dr. Gavin Conant; conantg@missouri.edu) or the co-PI (Dr. Chi-Ren Shyu; shyuc@missouri.edu).
该REU网站授予密苏里大学(MU),位于密苏里州哥伦比亚市,将在2014-2016年夏季为12名学生提供为期9周的培训。该奖项由生物科学部(生物基础设施部)和数学与物理科学部(数学科学部)共同支持。一对学生研究人员,一个来自计算科学,另一个来自生命科学,将在高性能计算和大数据生物学的界面上协同工作。学生将从不同的研究项目中进行选择,并从计算和生命科学的五个部门中选择导师。示例项目包括开发并行计算方法,以识别发生在重要进化转变(如哺乳动物胎盘的起源)中的基因复制,以及使用并行计算机和gpu根据高通量测序数据推断植物的生命树。此外,参与者还将参加其他校园暑期研究项目——参加专业发展会议,负责任的研究行为培训,并参加并行计算和生物学的每周会议。参与者将从各种院校招募,优先考虑来自少数民族院校和仅限本科院校的学生。pi和研究导师将选择参与者(一半来自计算科学,一半来自生命科学),并帮助他们选择计算或生物合作伙伴。参与者的进度将通过涵盖项目技术材料的前后测试进行评估。该项目将使用美国国家科学基金会的通用评估工具进行评估。随着下一代DNA测序仪等仪器产生的数据量不断增加,计算,尤其是并行计算,将对未来的科学和工程至关重要。REU提供的培训和研究经验将为参与者提供在这一重要领域接受培训的独特机会。学生在项目结束后需要被跟踪,并且必须回复通过NSF报告系统发送的自动电子邮件。欲了解更多信息,请访问http://muii.missouri.edu/reu_bigdata,或联系PI (Gavin Conant博士;conantg@missouri.edu)或副PI (shchi - ren博士;shyuc@missouri.edu)。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Gavin Conant其他文献

Gavin Conant的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Gavin Conant', 18)}}的其他基金

Inferring the gene coevolution network from deep comparative genomics
从深度比较基因组学推断基因协同进化网络
  • 批准号:
    2241312
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Standard Grant

相似国自然基金

新型WDR5蛋白Win site抑制剂的合理设计、合成及其抗肿瘤活性研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
具有共形结构的高性能Ta4SiTe4基有机/无机复合柔性热电薄膜
  • 批准号:
    52172255
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
    58 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于重要农地保护LESA(Land Evaluation and Site Assessment)体系思想的高标准基本农田建设研究
  • 批准号:
    41340011
  • 批准年份:
    2013
  • 资助金额:
    20.0 万元
  • 项目类别:
    专项基金项目

相似海外基金

REU Site: Microbial Biofilm Development, Resistance, & Community Structure
REU 网站:微生物生物膜的发展、耐药性、
  • 批准号:
    2349311
  • 财政年份:
    2025
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Collaborative Research: REU Site: Earth and Planetary Science and Astrophysics REU at the American Museum of Natural History in Collaboration with the City University of New York
合作研究:REU 地点:地球与行星科学和天体物理学 REU 与纽约市立大学合作,位于美国自然历史博物馆
  • 批准号:
    2348998
  • 财政年份:
    2025
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Collaborative Research: REU Site: Earth and Planetary Science and Astrophysics REU at the American Museum of Natural History in Collaboration with the City University of New York
合作研究:REU 地点:地球与行星科学和天体物理学 REU 与纽约市立大学合作,位于美国自然历史博物馆
  • 批准号:
    2348999
  • 财政年份:
    2025
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Standard Grant
IUCRC Phase I University of Wisconsin-Milwaukee: Center for Concrete Advancement Network (CAN), Lead Site
IUCRC 第一阶段威斯康星大学密尔沃基分校:混凝土进步网络中心 (CAN),主要站点
  • 批准号:
    2310861
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
CC* Networking Infrastructure: YinzerNet: A Multi-Site Data and AI Driven Research Network
CC* 网络基础设施:YinzerNet:多站点数据和人工智能驱动的研究网络
  • 批准号:
    2346707
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Standard Grant
REU Site: Computational Methods with applications in Materials Science
REU 网站:计算方法及其在材料科学中的应用
  • 批准号:
    2348712
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Standard Grant
REU Site: Accelerator and Nuclear Physics
REU 站点:加速器和核物理
  • 批准号:
    2348822
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Standard Grant
REU Site: University of Colorado, Engineering Smart Biomaterials
REU 站点:科罗拉多大学,工程智能生物材料
  • 批准号:
    2348856
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Standard Grant
REU Site: REU in Theoretical and Experimental Physics
REU 网站:REU 理论与实验物理
  • 批准号:
    2348872
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
REU Site: Ecology and Management for Resilient and Adapted Forests
REU 网站:弹性和适应性森林的生态和管理
  • 批准号:
    2348895
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 31.64万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了