Impact of crosstalk phenomena on the defense cis-regulatory landscape in Arabidopsis visualized with DNase-seq footprinting.
通过 DNase-seq 足迹可视化串扰现象对拟南芥防御顺式调控景观的影响。
基本信息
- 批准号:217161537
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Fellowships
- 财政年份:2012
- 资助国家:德国
- 起止时间:2011-12-31 至 2013-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
To understand how the plethora of possible combinatorial interplays between transcription factors (TFs) and their cognate cis-elements coordinates plant hormone signaling pathways, a comprehensive view of the cis-regulatory landscape is required. This proposal requests funding for the dynamic mapping of TF in vivo footprints in the model plant Arabidopsis thaliana utilizing DNase-seq footprinting with an emphasis on hormone crosstalk in defense responses. Plants de novo synthesize small signaling molecules called plant hormones upon pathogen infection in order to establish an adequate status of immunity. Depending on the lifestyle of the attacker, different hormones are employed to initiate the appropriate defense responses. Whereas salicylic acid (SA) is produced to effectively counteract biotrophic pathogens, the production of jasmonic acid (JA) and ethylene (ET) is essential to combat against necrotrophic pathogens. In case of concomitant infection of multiple pathogens with different lifestyles or pathogen-induced disturbances of the defense hormone homeostasis, plants require efficient crosstalk mechanisms between the hormone pathways to fine-tune their defense efforts and to avoid fitness losses. Mechanistic insights into the defense crosstalk machinery are still limited. To elucidate therefore how crosstalk phenomena between JA, ET and SA signaling are executed on the TF level, this project will generate the first dynamic surveys of the cis-regulatory architecture at the whole genome-level under different crosstalk conditions.
为了理解转录因子和它们的同源顺式元件之间的大量可能的组合相互作用如何协调植物激素信号通路,需要一个全面的顺式调控图景。这项提案要求提供资金,利用DNase-Seq足迹技术动态绘制模式植物拟南芥体内TF的足迹图,重点放在防御反应中的激素串扰。在病原体侵染时,植物从头开始合成称为植物激素的小信号分子,以建立适当的免疫状态。根据攻击者的生活方式,不同的荷尔蒙被用来启动适当的防御反应。虽然水杨酸(SA)的产生是为了有效地对抗生物营养性病原体,但茉莉酸(JA)和乙烯(ET)的产生是对抗坏死性病原体的关键。在不同生活方式的多个病原体同时侵染或病原体诱导的防御激素稳态被破坏的情况下,植物需要激素途径之间有效的串扰机制来微调它们的防御努力,避免适应性损失。对防御串扰机制的机械论见解仍然有限。因此,为了阐明JA、ET和SA信号之间的串扰现象是如何在Tf水平上执行的,该项目将首次在全基因组水平上动态调查不同串扰条件下的顺式调控结构。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Dr. Mark Zander其他文献
Dr. Mark Zander的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
相似国自然基金
基于TLR4/NF-κB与PPAR-γ/CD36信号通路间的crosstalk探讨黄芪多糖促进脑出血后血肿吸收的机制
- 批准号:JCZRQN202500623
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
西黄胶囊通过NLRP3/Caspase1/GSDMD/Beclin-1信号通路调控细胞焦亡-自噬Crosstalk机制治疗GLM的应用基础研究
- 批准号:2025JJ80699
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
Spp1介导肾-肌crosstalk参与儿童CKD致肌少症的作用和机制
研究
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于外泌体源性线粒体介导小胶质细胞-神经元crosstalk探讨改善AD认知的机制研究
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于线粒体生物发生介导的软骨细胞-巨噬细胞衰老Crosstalk探讨曲直汤延缓KOA进展的作用机制
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于胰岛巨噬细胞-β细胞免疫Crosstalk诱导β细胞去分化研究T2DM“火”-“气”互作科学内涵及泻火固正法干预机制
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:15.0 万元
- 项目类别:省市级项目
HDACs信号通路通过与星形胶质细胞NF-κb信号通路Crosstalk调控TREM2+小胶质细胞影响糖尿病脑卒中后神经功能的研究
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:15.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于Exos-miRHAs探讨大量灵仙方调控肝巨细胞-胆管细胞crosstalk参与胆管炎性-EMT持抗胆石形成的机制研究
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0 万元
- 项目类别:面上项目
“肌-脑crosstalk”视阈下太极拳训练对2型糖尿病合并脑小血管病患者的脑血管保护效应研究
- 批准号:2024Y9478
- 批准年份:2024
- 资助金额:50.0 万元
- 项目类别:省市级项目
复方肠泰方通过“ 精氨酸甲基化-泛素化crosstalk”调控铁死亡
的抗结直肠癌作用机制研究
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
相似海外基金
Investigation of crosstalk between Fanconi Anemia pathway and ATM for novel therapeutic strategies of chemoresistant ALT-positive high-risk neuroblastoma
范可尼贫血通路与 ATM 之间的串扰研究,用于化疗耐药 ALT 阳性高危神经母细胞瘤的新治疗策略
- 批准号:
24K10442 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
"Mimicking Human Head Sound Responses": Towards an Anatomically Accurate Head Prototype for Bone Conduction Crosstalk Cancellation Analysis with Humans
“模仿人类头部声音反应”:构建解剖学上准确的头部原型,用于人类骨传导串扰消除分析
- 批准号:
24K20786 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Crosstalk between purinergic signaling and the complement system in sepsis-induced immunosuppression.
脓毒症引起的免疫抑制中嘌呤能信号传导与补体系统之间的串扰。
- 批准号:
23H03013 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Friends or foes: dissecting the crosstalk between stress granules and viruses during infection
朋友还是敌人:剖析感染过程中应激颗粒和病毒之间的串扰
- 批准号:
BB/W015536/2 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grant
Crosstalk between PAK1 signalling and intracellular trafficking
PAK1 信号传导与细胞内运输之间的串扰
- 批准号:
MR/X008649/1 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grant
UNRAVELLING THE CROSSTALK BETWEEN TISSUE-RESIDENT CD4+ T CELLS AND STROMAL CELLS DRIVING LIVER FIBROSIS
解开组织驻留 CD4 T 细胞和基质细胞之间驱动肝纤维化的串扰
- 批准号:
EP/X020827/1 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grant
CAREER: Understanding the Immunometabolism-Epigenetic Crosstalk in Dendritic Cells
职业:了解树突状细胞中的免疫代谢-表观遗传串扰
- 批准号:
2412256 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Continuing Grant
Mechanisms underlying Sex differences in Cerebral Amyloid Angiopathy: The Fibrin-Microglia Crosstalk
脑淀粉样血管病性别差异的潜在机制:纤维蛋白-小胶质细胞串扰
- 批准号:
10662862 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Epithelial-mesenchymal crosstalk in intestinal polyp formation
肠息肉形成中的上皮-间质串扰
- 批准号:
10604626 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Actin gating of crosstalk between Rho GTPases in cell migration
细胞迁移中 Rho GTP 酶之间串扰的肌动蛋白门控
- 批准号:
10736927 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别: