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Analysis of microProteins miP1a and miP1b in the regulation of flowering time in Arabidopsis

拟南芥微量蛋白miP1a和miP1b调控开花时间的分析

基本信息

批准号：
230144755
负责人：
Professor Dr. Stephan Wenkel
金额：
--
依托单位：
Department of Plant and Environmental Sciences
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2013
资助国家：
德国
起止时间：
2012-12-31 至 2016-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/230144755?language=en
关键词：
Analysis microProteins miP1a miP1b regulation

项目摘要

MikroProteine (miPs) sind kleine Proteine, die hauptsächlich aus einer einzigen funktionellen Domäne bestehen die ebenfalls in größeren Multidomänen-Proteinen vorkommt. Während meines Postdoc Aufenthaltes konnte ich die ersten MikroProteine aus Pflanzen beschreiben. Bei diesen miPs handelt es sich um die LITTLE ZIPPER (ZPR) miProteinfamilie. ZPR Gene sind Zielgene von Klasse III HDZIP (HD-ZIPIII) Transkriptionsfaktoren. ZPR Proteine bestehen hauptsächlich aus einer Leuzin Zipper Domäne und interagieren mit HD-ZIPIII Proteinen. HD-ZIPIII/ZPR heterodimere Komplexe können nicht an DNA binden weshalb ZPR Proteine HD-ZIPIIIs post-translational inhibieren. Ein Charakteristikum von miPs ist die dominant-negative Funktionsweise. miProteine kommen sowohl in Pflanzen als auch in Tieren vor. Wir haben einen bioinformatischen Ansatz gewählt um neue miPs im Proteom von Arabidopsis zu finden. Zwei der identifizierten Proteinen sind kleine B-Box Proteine, miP1a und miP1b, die aus einer einzigen B-Box-Domäne bestehen. Die B-Box-Domäne ähnelt der B-Box von CONSTANS (CO) und CONSTANS-like (COL) Proteinen. Um Protein-Interaktionspartner von miP1a/b zu finden haben wir direkte Hefe-2-Hybrid Tests mit allen Arabidopsis B-Box Proteinen durchgeführt. In diesen Tests konnte CO als Interaktionspartner von miP1a/b gefunden werden. Die Analyse von transgenen Pflanzen mit erhöhten miR1a/b Expressionsniveaus hat ergeben, dass miP1a/b die Blütenbildung stark verlangsamen können, was auf eine reduzierte Aktivität von CO hindeutet. Dieser Antrag beschreibt die funktionelle Analyse der miP1a/b Proteine aus Arabidopsis. Zum einen möchten wir die gefundenen Protein-Interaktionen bestätigen und genauer quantifizieren, zum anderen möchten wir Verlustmutanten als auch Reporterlinien untersuchen. Eine genetische Analyse mit Blühzeit-Mutanten soll es uns ermöglichen miP1a/b in das Netzwerk der Blütezeitfaktoren einzuordnen.

mickroproteine （miPs）和kleine Proteine， die hauptsächlich和einer einzigen的功能在größeren Multidomänen-Proteinen vorkommt中表现得最好。Während meines博士后Aufenthaltes konnte ich die ersten microproteine aus Pflanzen beschreiben。bedisenmips处理的是一个小拉链（ZPR）蛋白家族。ZPR基因与Zielgene von Klasse III HDZIP （HD-ZIPIII）转录分析ZPR蛋白是由hauptsächlich和其他的拉链Domäne以及HD-ZIPIII蛋白组成的。HD-ZIPIII/ZPR异质二聚体können与DNA结合weshalb ZPR蛋白HD-ZIPIII翻译后抑制剂。in Charakteristikum von miPs ist为显性阴性。蛋白类蛋白在蛋白类蛋白中也存在于蛋白类蛋白中。[4] [j] .生物信息学研究进展[j] . gewählt .新发现的拟南芥蛋白。Zwei der鉴定了kleine B-Box蛋白、miP1a和miP1b，并鉴定出了miP1a和miP1b。Die B-Box-Domäne ähnelt der B-Box von CONSTANS (CO) and CONSTANS-like (COL) proteen。对拟南芥b - box蛋白进行了hefe -2杂交试验，研究了miP1a/b蛋白的相互作用。在柴油测试中，我们的合作伙伴miP1a/b是通用的。Die Analyse von transgenen Pflanzen mit erhöhten miR1a/b表达分析结果表明，ergeben, pass miP1a/b Die bl<s:1> tenbildung stark verlangsamen können，是auine reduzierte Aktivität von CO indeteet。拟南芥中miP1a/b蛋白的分析。Zum einen möchten wir die gefundenen Protein-Interaktionen bestätigen and genauer quantifizien, Zum anderen möchten wir Verlustmutanten als . reporterlinen intersuchen。遗传分析mit bl<s:1> hzeitfaktoren einzuordnen的基因突变位点ermöglichen miP1a/b。