SBIR Phase I: HiUGE Powered CRISPR Knock-In Library for Protein Tagging Across the Human Genome
SBIR 第一阶段:HiUGE 驱动的 CRISPR 敲入文库,用于人类基因组中的蛋白质标记
基本信息
- 批准号:2036256
- 负责人:
- 金额:$ 25.57万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:Standard Grant
- 财政年份:2021
- 资助国家:美国
- 起止时间:2021-02-15 至 2023-01-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
The broader impact/commercial potential of this Small Business Innovation Research (SBIR) Phase I project impacts the ability of drug developers, translational investigators, and basic scientists to track proteins in living cells. Current approaches are time-consuming, labor-intensive and low-throughput. Investing in these approaches is therefore relatively high-risk for most investigators and are most often employed only for proteins with well-defined functions. This technology represents a rapid and scalable method for protein labeling, allowing investigators to include a broader range of proteins of interest (POIs) in a given study. By reducing the initial investment required, both academic and industry investigators are likely to expand the POIs included in a given study. Our expectation is that the scalability and flexibility of this method will accelerate drug screening and development activities, revealing more promising lead candidates. The proposed project will advance translation of the homology-independent universal genome engineering (HiUGE) method, developed as a means of evaluating a broad range of proteins in neural function and development. This project advances research in developing a number of functional knock-in vectors, allowing fluorescent proteins labeling (FluorTag), functional disruption (DisrupTag), and downstream protein purification (MassTag). Pairing these vectors with the genome-wide library under development during this project will allow the company to rapidly provide cell lines expressing proteins of interest with customized modifications, all under endogenous promoter control. The specific goal of this project is to develop a scalable, high-throughput screening platform using the technology to label every protein encoded by the human genome. Technical tasks include: identify gene specific-gRNA sequences for all coding regions, searching and prioritizing insertion sites both at the N- and C-terminal regions of all proteins using defined criteria; develop a pilot scale screening library, comprising cells with HiUGE insertion sites in 96 genes of interest; apply new automation resources to scale for all 20,000 protein-encoding genes.This award reflects NSF's statutory mission and has been deemed worthy of support through evaluation using the Foundation's intellectual merit and broader impacts review criteria.
这个小企业创新研究(SBIR)第一阶段项目的更广泛的影响/商业潜力影响了药物开发人员,翻译研究人员和基础科学家跟踪活细胞中蛋白质的能力。目前的方法是耗时,劳动密集型和低吞吐量。因此,对大多数研究人员来说,投资这些方法的风险相对较高,并且通常仅用于具有明确功能的蛋白质。这项技术代表了一种快速和可扩展的蛋白质标记方法,使研究人员能够在给定的研究中包括更广泛的感兴趣的蛋白质(POI)。通过减少所需的初始投资,学术和行业调查人员都有可能扩大特定研究中包含的POI。我们的期望是,这种方法的可扩展性和灵活性将加速药物筛选和开发活动,揭示更多有前途的先导候选药物。 拟议的项目将推进同源独立通用基因组工程(HiUGE)方法的翻译,该方法是作为评估神经功能和发育中广泛蛋白质的一种手段而开发的。该项目推进了开发许多功能性敲入载体的研究,允许荧光蛋白标记(FluorTag),功能性破坏(DisrupTag)和下游蛋白纯化(MassTag)。将这些载体与该项目期间正在开发的全基因组文库配对,将使该公司能够快速提供表达具有定制修饰的感兴趣蛋白质的细胞系,所有这些都在内源性启动子控制下。该项目的具体目标是开发一个可扩展的高通量筛选平台,使用该技术标记人类基因组编码的每个蛋白质。技术任务包括:鉴定所有编码区的基因特异性gRNA序列,使用定义的标准搜索所有蛋白质的N-和C-末端区域处的插入位点并对其进行优先级排序;应用新的自动化资源来扩展所有20个,该奖项反映了NSF的法定使命,并通过使用基金会的知识价值和更广泛的影响审查标准进行评估,被认为值得支持。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Akiyoshi Uezu其他文献
Activation of Ca2+/calmodulin‐dependent protein kinase I in cultured rat hippocampal neurons
培养的大鼠海马神经元中 Ca2+/钙调蛋白依赖性蛋白激酶 I 的激活
- DOI:
10.1046/j.1471-4159.2002.00984.x - 发表时间:
2002 - 期刊:
- 影响因子:4.7
- 作者:
Akiyoshi Uezu;K. Fukunaga;J. Kasahara;E. Miyamoto - 通讯作者:
E. Miyamoto
Akiyoshi Uezu的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
相似国自然基金
Baryogenesis, Dark Matter and Nanohertz Gravitational Waves from a Dark
Supercooled Phase Transition
- 批准号:24ZR1429700
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
ATLAS实验探测器Phase 2升级
- 批准号:11961141014
- 批准年份:2019
- 资助金额:3350 万元
- 项目类别:国际(地区)合作与交流项目
地幔含水相Phase E的温度压力稳定区域与晶体结构研究
- 批准号:41802035
- 批准年份:2018
- 资助金额:12.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
基于数字增强干涉的Phase-OTDR高灵敏度定量测量技术研究
- 批准号:61675216
- 批准年份:2016
- 资助金额:60.0 万元
- 项目类别:面上项目
基于Phase-type分布的多状态系统可靠性模型研究
- 批准号:71501183
- 批准年份:2015
- 资助金额:17.4 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
纳米(I-Phase+α-Mg)准共晶的临界半固态形成条件及生长机制
- 批准号:51201142
- 批准年份:2012
- 资助金额:25.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
连续Phase-Type分布数据拟合方法及其应用研究
- 批准号:11101428
- 批准年份:2011
- 资助金额:23.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
D-Phase准晶体的电子行为各向异性的研究
- 批准号:19374069
- 批准年份:1993
- 资助金额:6.4 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
UK involvement in LSST: Phase C (Imperial component)
英国参与 LSST:C 阶段(帝国部分)
- 批准号:
ST/X001326/1 - 财政年份:2025
- 资助金额:
$ 25.57万 - 项目类别:
Research Grant
Phase 2 - Effective and Integrated Chemical Free Robotic Milking
第 2 阶段 - 有效且集成的无化学品机器人挤奶
- 批准号:
10093094 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 25.57万 - 项目类别:
Collaborative R&D
Net Zero Pathfinder - Phase 2 Manchester
净零探路者 - 第二阶段曼彻斯特
- 批准号:
10095254 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 25.57万 - 项目类别:
Demonstrator
Phase Averaged Deferred Correction for Multi-Timescale Systems
多时间尺度系统的相位平均延迟校正
- 批准号:
EP/Y032624/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 25.57万 - 项目类别:
Research Grant
Model order reduction for fast phase-field fracture simulations
快速相场断裂模拟的模型降阶
- 批准号:
EP/Y002474/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 25.57万 - 项目类别:
Research Grant
IUCRC Phase I University of Wisconsin-Milwaukee: Center for Concrete Advancement Network (CAN), Lead Site
IUCRC 第一阶段威斯康星大学密尔沃基分校:混凝土进步网络中心 (CAN),主要站点
- 批准号:
2310861 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 25.57万 - 项目类别:
Continuing Grant
IUCRC Phase III University of Colorado Boulder: Center for Membrane Applications, Science and Technology (MAST)
IUCRC 第三阶段科罗拉多大学博尔德分校:膜应用、科学与技术中心 (MAST)
- 批准号:
2310937 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 25.57万 - 项目类别:
Continuing Grant
SBIR Phase II: Innovative Two-Phase Cooling with Micro Closed Loop Pulsating Heat Pipes for High Power Density Electronics
SBIR 第二阶段:用于高功率密度电子产品的创新两相冷却微闭环脉动热管
- 批准号:
2321862 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 25.57万 - 项目类别:
Cooperative Agreement
SBIR Phase I: Industrial-Scale Technology for Drug Development in Mature Human Fat Cells
SBIR 第一阶段:成熟人类脂肪细胞药物开发的工业规模技术
- 批准号:
2322443 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 25.57万 - 项目类别:
Standard Grant
STTR Phase II: Fabrication and Structural Testing of a 3D Concrete Printed Anchor for Floating Offshore Wind
STTR 第二阶段:用于浮动海上风电的 3D 混凝土打印锚的制造和结构测试
- 批准号:
2333306 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 25.57万 - 项目类别:
Cooperative Agreement