Flüssigkeitschromatographie gekoppelt mit Massenspektrometrie (nano-LCMS)

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Der Sonderforschungsbereich 796 „Steuerungsmechanismen mikrobieller Effektoren in Wirtszellen“ untersucht die Wechselwirkungen viraler und bakterieller Virulenzproteine mit pflanzlichen bzw. humanen Wirtszellen. Bei 14 der bewilligten 16 Teilprojekte sind Untersuchungen zu posttranslationalen Proteinmodifikationen und zu Protein-Protein Wechselwirkungen von zentraler Bedeutung.Um diese Untersuchungen zu gewährleisten wurde die Etablierung einer zentralen Proteom-Plattform beantragt. Diese Plattform muss in der Lage sein, eine extrem hohe Peptidsequenzabdeckung bei gleichzeitig höchster Massengenauigkeit zu gewährleisten. Dies ist sowohl für die Identifizierung von Proteingemischen, als auch zur Bestimmung von post-translationalen Proteinmodifikationen erforderlich. Hochauflösende Massenspektrometer gekoppelt mit einer Hochdruckflüssigkeitschromatographie sind am besten für diese Untersuchungen geeignet.