Eine neue semi-implizite Methode für molekulare Simulationen in komplexen Systemen

复杂系统中分子模拟的一种新的半隐式方法

• 批准号: 24900428
• 负责人: Professor Dr. Kai Leonhard
• 金额: --
• 依托单位: Lehrstuhl für Technische Thermodynamik (LTT)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2005-12-31 至 2014-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/24900428?language=en
• 关键词: Eine; neue; semi; implizite; Methode

Komplexe Systeme, insbesondere Biosysteme, unterliegen häufig komplizierten Wechselwirkungen, die durch gekoppelte Form- und Krafteffekte gekennzeichnet sind. Sie können bisher weder durch molekulare Simulationen noch mittels analytischer Modelle ausreichend genau und gleichzeitig mit befriedigendem Rechenaufwand beschrieben werden. Die bei solchen Systemen angewandten Computer Simulationen mit explizit berücksichtigten Solvent-Molekülen sind für praktisch interessante Systeme zu zeit auf wendig. Auf der anderen Seite sind Simulationen mit implizit modellierten Solvent-Molekülen für viele Anwendungen nicht aussagefähig genug. Hier soll daher ein neues, semi-implizites Computersimulationsverfahren entwickelt werden, das auf einer Kombination von Monte Carlo- Simulationen und COSMO-RS basiert. Die neue Methode ist insofern semi-implizit, als dass alle Interaktionen der Lösungsmittelmoleküle sich aus den mit COSMO-RS erhaltenen Kontakthäufigkeiten unabhängiger Segmente ergeben, die Wechselwirkungen zwischen den Molekülen der gelösten Stoffe hingegen unter voller Berücksichtigung der geometrischen Orientierung erfasst werden. Daher brauchen nicht immer wieder neue Konfigurationen der Lösungsmittelmoleküle ausgewertet zu werden. Mit der vorgeschlagenen semi-impliziten Methode lassen sich Simulationen mit ähnlichem Rechenaufwand wie mit impliziten Methoden durchführen, allerdings mit einer besseren Wiedergabe struktureller Einflüsse des Lösungsmittels auf die gelösten Moleküle. Damit erschließt die neue Methode neue Anwendungen im Bereich der Untersuchung komplexer Systeme.

complex system, insonderere biosystem, unterliegen häufig komplizierten Wechselwirkungen, die durch gekoppelte Form- and Krafteffekte gekennzeichnet sind。参见können bisher der durch molecular simulation（分子模拟），分析模型（Modelle ausreichend genau和gleichzetig）。基于数学模型的数学模拟研究：基于数学模型的数学模拟：<s:1>化学溶剂-分子<e:1>动力学分析；在模拟过程中，采用隐式模型模拟溶剂-分子<s:1> len f<e:1>。他们的新理论，半隐式计算机模拟，以及蒙特卡罗-模拟和cosmos - rs基础的结合。Die neue method ist in sofinin半隐式，也可以通过alle Interaktionen der Lösungsmittelmoleküle . sich de cosmos - rs erhaltenen Kontakthäufigkeiten unabhängiger Segmente ergeben, Die Wechselwirkungen zwischen den molek<e:1> len der gelösten . Stoffe hingegen undervoller bercksichtigung der geometrischen Orientierung erfast werden。Daher brauchen night immer wider new configurationen der Lösungsmittelmoleküle ausgewertet zu werden。Mit der vorgeschlagenen半隐式方法lassen sich Simulationen Mit ähnlichem Rechenaufwand Mit Mit隐式方法durchfhren， allerdings Mit einer besseren Wiedergabe struktureller einflsse des Lösungsmittels auf die gelösten molek<e:1> le。Damit erschliet die neue method neue Anwendungen im Bereich der tersuchung complexer system。