Transcriptional definition of cell phenotype and immune function in vitro and in vivo (Z05*)

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Die Charakterisierung von Immunzellen mittels genomweiter Technologien wird zunehmend wichtiger um neue Zelltypen oder -subtypen zu definieren oder neue Funktionen bekannter Zellen im lokalen Mikromilieu zu bestimmen. Immunregulatorische Mechanismen sind fast ausschließlich transkriptionell definiert. Wir haben deshalb in die Entwicklung neuer Technologien wie RNA-Seq, ChIP-Seq, oder miRNA-Seq und deren Analyse investiert. Zudem werden wir unser bioinformatisches Repertoire um Techniken wie Weighted Coexpression Network Construction, Modular Analysis, Differential Connectivity, oder Context-Specific Neighbor Identification erweitern, um die analytischen Möglichkeiten für Kooperationsprojekte im SFB weiter zu verbessern.