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Rechencluster

Rechencluster
计算集群
批准号:
261833929
负责人:
金额:
$0.0万
依托单位:
依托单位国家:
德国
项目类别:
Major Research Instrumentation
财政年份:
2014
资助国家:
德国
项目状态:
未结题
起止时间:
2013-12-31 至 --
关键词:

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
Am Institut für Computerphysik stellen Hoch- und Höchstleistungsrechner bei einer großen Mehrheit der Projekte das Hauptwerkzeug dar.这种中间方法,都是分子动力学模拟的,也有混合模拟的,这种方法也有量子力学方法。韦尔登知道的问题,我们可以从Rechenzeit ab的Verfügbarkeit得到。在Höchstleistungsrechenzentren中,Dabei sind die Projekte often nicht geeignet für die Supercomputer。Einerseits sind die simulierten Systeme häufig häufig besonders grounds,stattdessen müssen jedoch Tausbenvon Einzelsimulationen durchgeführt韦尔登.在GPU上运行的许多程序中,有一个是德国的Leistungsgewinn mit sich bringt。ICP也可以通过方法的开发、优化和验证来实现。Leider müssen die Computer dafür häufig umkonfiguriert韦尔登,was in Höchstleistungsrechenzentren unmöglich ist.这台机器被重新组装了。一个带有特殊节点的机器将通过标准硬件实现单个节点的集群,i.d.R. mit einer GPU ausgestattet sind,zusätzlich ein leistungsfähiges paralleles Speichersystem.
英文摘要
Am Institut für Computerphysik stellen Hoch- und Höchstleistungsrechner bei einer großen Mehrheit der Projekte das Hauptwerkzeug dar. Die zentralen Methoden, sind vor allem Molekulardynamiksimulationen, sowie hybride Simulationen, die mehrere Skalen koppeln, ferner auch quantenmechanische Methoden. Welche Probleme behandelt werden können, hängt wesentlich von der Verfügbarkeit von Rechenzeit ab. Dabei sind die Projekte oft nicht gut geeignet für die Supercomputer in Höchstleistungsrechenzentren. Einerseits sind die simulierten Systeme häufig nicht besonders groß, stattdessen müssen jedoch Tausende von Einzelsimulationen durchgeführt werden. Weiterhin unterstützen viele Algorithmen die Berechnung auf GPUs, was einen deutlichen Leistungsgewinn mit sich bringt. Schließlich beteiligt sich das ICP maßgeblich auch an der Entwicklung, Optimierung und Verifikation der Methoden. Leider müssen die Computer dafür häufig umkonfiguriert werden, was in Höchstleistungsrechenzentren unmöglich ist. Die beantragte Maschine trägt diesem Muster Rechnung. Anstelle einer teuren Maschine mit gut vernetzten Spezialknoten wird ein Cluster von individuell konfigurierbaren Knoten aus Standardhardware beantragt, die i.d.R. mit einer GPU ausgestattet sind, zusätzlich ein leistungsfähiges paralleles Speichersystem.
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1039/c7cp03717a
发表时间: 2017-07
期刊: Physical chemistry chemical physics : PCCP
影响因子: --
作者: [Takeshi Kobayashi;J. Reid;S. Shimizu;M. Fyta;Jens Smiatek]
通讯作者: Takeshi Kobayashi;J. Reid;S. Shimizu;M. Fyta;Jens Smiatek
A dsDNA model optimized for electrokinetic applications.
针对电动应用优化的 dsDNA 模型
DOI: 10.1039/c7sm00270j
发表时间: 2017
期刊: Soft matter
影响因子: 3.4
作者: [T. Rau, F. Weik, C. Holm]
通讯作者: C. Holm
DOI: 10.1063/1.5016814
发表时间: 2018-02
期刊: The Journal of chemical physics
影响因子: --
作者: [Alexander Weyman;M. Bier;Christian Holm-;Jens Smiatek]
通讯作者: Alexander Weyman;M. Bier;Christian Holm-;Jens Smiatek
DOI: 10.1021/acs.jctc.7b00903
发表时间: 2018-01
期刊: Journal of chemical theory and computation
影响因子: 5.5
作者: [F. Uhlig;Johannes Zeman;Jens Smiatek;Christian Holm-]
通讯作者: F. Uhlig;Johannes Zeman;Jens Smiatek;Christian Holm-
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